慢性肾脏病5期血液透析患者的口腔菌群构成差异研究

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目的:2007年美国国立卫生研究院(National Institutes of Health,NIH)为了揭示微生物与人体疾病之间的联系,启动了人类微生物组计划(Human Microbiome Project,HMP)。自此,各国关于人体微生物组的研究达到了空前火热的水平。2008年NIH牙颅颌面研究所(National Institute of Dental and Craniofacial Research,NIDCR)启动了人体口腔微生物组数据库(Human Oral Microbiome Database,HOMD)计划,HOMD是第一个对人类相关微生物组的规划描述,为理解微生物组在健康和疾病中的作用提供了工具。HOMD的主要目标是提供数百种人体口腔原核生物物种群落的全面信息。2015年再次启动了“全民个体微生物组检测项目”,旨在以口腔、皮肤及肠道微生物群落为主要研究靶点,将“人类微生物组计划”的研究结果进行临床转化,从“第二基因组”中寻找更加精准的疾病预警分子。通过高通量16S r RNA测序分析口腔菌群基因,结合代谢组学方法筛选差异代谢物,探讨慢性肾脏病5期血液透析患者与健康对照者口腔菌群多样性差异及其代谢产物差异,为调节口腔菌群辅助治疗慢性肾脏病提供理论依据。方法:1、在研究对象知情同意的情况下选择我院就诊的慢性肾脏病5期血液透析患者25例,选择同一时期来自医院体检中心的健康者25例作为对照组,分别取其唾液作为研究样本。2、研究慢性肾脏病5期血液透析患者与健康对照者的口腔菌群多样性,采用高通量测序及代谢产物测定,比较不同群体菌群的构成差别、代谢产物构成差别,了解慢性肾脏病5期血液透析患者菌群构成的特点。结果:1、慢性肾脏病5期血液透析组以及健康对照组间性别、年龄和体重指数的一般情况单因素分析,无显著差异(P>0.05)。2、使用usearch软件对质控后的reads进行去嵌合体,在相似度为0.97的条件下进行聚类,所有样品共得到1336个不同的OTU,将OTU与已探明16S的物种的数据库比对,对每个OTU进行物种注释,在界水平得到1个物种,门水平22个物种,纲水平45个物种,目水平71个物种,科水平122个物种,属水平189个物种。3、统计属水平细菌显著差异性分析,各组间口腔菌群的结构存在不同。慢性肾脏病5期血液透析组与健康人对照组相比,在对照组中贡献度较大的相关差异菌属(按降序):Haemophilus、Aggregatibacter、Mogibacterium、Actinobacillus、Escherichia、Leptothrix、Sutterella等菌属。在慢性肾脏病5期血液透析组中贡献度较大的相关差异菌属(按降序):Leptotrichia、Capnocytophage、Corynebacterium、Burkholderia、Odoribacter、Allobaculum、Azospira、Salinibacterium、Agrobacterium等菌属。结论:1、口腔内有丰富的共生群落,慢性肾脏病5期血液透析病人及健康对照者之间的口腔菌群构成存在着显著差异。慢性肾脏病5期血液透析病人差异贡献度最大的为:Leptotrichia、Capnocytophage、Corynebacterium、Burkholderia、Odoribacter、Allobaculum、Azospira、Salinibacterium、Agrobacterium等菌属。健康对照组中贡献度较大的相关差异菌属(按降序):Haemophilus、Aggregatibacter、Mogibacterium、Actinobacillus、Escherichia、Leptothrix、Sutterella等菌属。2、CKD5期血液透析病人与口腔菌群失调具有相关性,口腔菌群失调,诱发微炎症状态,引起系统性炎症反应,继而导致机体免疫失调,从而加速CKD慢性肾脏病的进展和心血管并发症的产生。而随着CKD病情发展,又促使口腔菌群失调,二者互为因果,最终导致预后不良。预示可以通过调节口腔菌群,延缓慢性肾脏病病情进展及并发症发生。
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