本试验以伊犁马为研究对象,选取DMRT3、MSTN以及ACTN3基因作为运动马运动性能候选基因,利用PCR-SSCP、PCR-RFLP和DNA测序技术检测基因的多态性,筛选影响伊犁马运动性能的分子标记,研究DMRT3、MSTN、ACTN3基因与马匹运动性能的关系,为进一步从分子水平探索伊犁马品种的运动性能遗传机制提供前期研究基础和技术支持,试验研究结果如下:1、伊犁马DMRT3基因遗传多态性及其与步法性状的相关性分析对不同类型伊犁马DMRT3基因第1外显子遗传多态性检测,其中伊犁马DMRT3基因多态性研究属首次。研究发现该基因存在多态性,测序结果显示,DMRT3基因的SNP位置g.22999655C>A,该突变为无义突变,该突变导致了其编码的氨基酸提前终止而缩短了蛋白序列,产生了3种基因型:CC、CA和AA,C为优势等位基因。经关联分析,对侧步型个体速度快于快步型(P<0.05);该突变与伊犁马步法类型不关联;但对对伊犁马速步赛速度有显著影响(P<0.05)。伊犁马DMRT3基因突变与速度之间存在关联性,且可能是伊犁马步法性状的重要位点。2、伊犁马MSTN基因多态性及其与中长比赛距离的相关性分析对4组参赛伊犁马MSTN基因第1内含子遗传多态性检测,研究发现MSTN基因存在多态性,测序结果显示,MSTN基因的SNP位置g.66493737C>T,产生了3种基因型:CC、CT和TT,在2km和15km组中,C为优势等位基因;在3km和5km组中,T为优势等位基因。经关联分析,在5km组中,该突变对速度有显著影响(P<0.05)。伊犁马MSTN基因突变与速度之间存在关联性,且可能是伊犁马中长比赛距离重要位点。3、伊犁马ACTN3基因遗传多态性研究对不同类型伊犁马ACTN3基因遗传多态性检测,研究发现该基因的第10、11以及16外显子不存在多态性。