烤烟是我国重要的经济作物,玉米是我国重要的粮食作物,广泛分布于贵州省等西南地区。烤烟和玉米生产对于我国国民经济可持续发展和当地的粮食供应十分重要。在农业生产中,施肥及种植是最主要的农艺措施,直接影响作物产量品质和土壤健康质量。土壤微生物是生态系统中的重要成分之一,参与土壤中的各种生物化学反应,如土壤有机质矿化,无机养分活化,病原微生物生长繁殖等,对土壤肥力,作物生长发育,产量形成和病虫害防治等方面均有极其重要的作用。本论文利用贵州省烟草农业科学研究院的长期定位肥料试验,利用常规培养计数和分子生物学技术,研究了种植施肥对土壤微生物数量和细菌群落结构的影响,旨在为烤烟和玉米科学种植和施肥,改善土壤健康质量,提高作物产量品质积累资料,促进当地烤烟和玉米生产的可持续发展。本试验共设置8个处理,分别为不施肥、施氮肥、施氮+磷肥、施氮+钾肥、施氮磷钾肥、施氮磷钾+农家肥、以及常规施肥+生物有机肥；种植方式为烤烟—玉米轮作、烤烟—烤烟连作、玉米—玉米连作。主要研究结果如下：1、通过传统培养计数方法,研究不同施肥处理对烤烟和玉米根际土壤微生物数量的变化规律,得出在烤烟团棵期、旺长期和成熟期,有机无机肥配施(化肥+农家肥或生物有机肥)处理的土壤根际细菌、放线菌数量高于其他处理；在玉米拔节期、大喇叭口期和成熟期,有机无机肥配施(化肥+农家肥或生物有机肥)处理的土壤根际细菌数量也高于其他处理；在玉米整个生育期,化肥配施生物有机肥的土壤根际放线菌数量均高于其他处理。2、利用PCR-DGGE法,研究不同施肥处理对烤烟根际土壤细菌群落结构的影响规律,得出在烤烟移栽时,除不施肥的处理外,其他处理的根际细菌群落结构差异不明显；移栽后,化肥配施农家肥的根际细菌群落结构显著不同于其他处理；在团棵期和打顶期,不施肥和“化肥+农家肥”处理的根际细菌群落结构相似度高；烤烟成熟后,施肥对土壤细菌群落结构已无显著影响。3、利用PCR-DGGE法,研究不同施肥处理对玉米根际土壤细菌群落结构的影响规律,得出在玉米采收前,只施氮肥和“氮肥+磷肥”处理的根际土壤细菌群落结构较相似,施用氮磷钾肥和“化肥+农家肥”处理的根际细菌群落结构也比较类似,表明在玉米生长期施肥对土壤细菌群落结构产生显著差异。但在玉米采收后,施肥对土壤细菌群落结构已无明显影响。4、利用PCR-DGGE法,研究两种种植方式对玉米和烤烟根际土壤细菌群落结构的影响规律,得出在玉米—玉米连作与烤烟—玉米轮作的玉米根际土壤中,细菌群落结构显著不同,连作玉米根际土壤的细菌DNA条带显著多于种植烤烟后的玉米土壤；在烤烟—烤烟连作和烤烟—玉米轮作的烤烟土壤中,细菌群落结构差异较小。在烤烟—玉米轮作的烤烟土壤中,某些DNA条带所代表的细菌数量更为丰富。5、不同种植方式下的烤烟和玉米根际土壤中,细菌的群落结构总体相似,但仍有细微差异,短时问的种植方式对土壤细菌群落结构影响不大,但种植方式对土壤细菌群落结构的影响可能积微成显。