【摘 要】
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目的:胃癌是世界范围内最常见的恶性肿瘤之一,严重威胁着人类的生命安全。本研究的目的是通过构建竞争性内源性RNA(ceRNA)调控网络,探索新的胃癌预后标志物。此外,免疫细胞已成为多种肿瘤发生和发展中的关键调节因子。我们利用免疫基因构建胃癌的预后模型,从而更好的预测胃癌患者的预后。方法:我们从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载了RNA表达数据。通过比较胃癌样本与正常组织样本筛选出差异表达的长链非
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目的:胃癌是世界范围内最常见的恶性肿瘤之一,严重威胁着人类的生命安全。本研究的目的是通过构建竞争性内源性RNA(ceRNA)调控网络,探索新的胃癌预后标志物。此外,免疫细胞已成为多种肿瘤发生和发展中的关键调节因子。我们利用免疫基因构建胃癌的预后模型,从而更好的预测胃癌患者的预后。方法:我们从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载了RNA表达数据。通过比较胃癌样本与正常组织样本筛选出差异表达的长链非编码RNA(lnc RNA),mRNA和微小RNA(miRNA)。根据ceRNA假说提出的miRNA与lnc RNA/mRNA之间相互作用关系,构建了ceRNA调控网络,并对ceRNA网络中的靶基因进行了功能富集分析。另外我们还对ceRNA网络中的RNA进行生存分析,筛选出与胃癌预后相关的RNA。使用Immport数据库和差异表达算法筛选出胃癌的免疫相关差异表达基因。通过COX回归分析和随机生存森林(RSF)预测免疫相关预后基因并构建生存模型,然后通过TIMER数据库分析免疫基因表达与各种免疫细胞浸润的相关性。结果:通过将胃癌样本和正常样本比较,共有64个lnc RNA,10个miRNA和10个mRNA被纳入进我们的ceRNA网络中。基因功能富集分析结果表明ceRNA中的靶基因与ATP酶的活性,受体结合,血管生成和胞外外泌体的功能相关。生存分析共鉴定出了7个lnc RNA,2个miRNA和2个mRNA与胃癌预后相关。在胃癌和正常组织之间共筛选出了155个差异表达的免疫相关基因,并且由4个免疫相关预后基因(NRP1,PPP3R1,IL17RA和FGF16)组成的免疫预后模型与胃癌的总体生存率(OS)密切相关。根据风险评分截断值,将患者分为高危组和低危组。在训练组(P<0.0001)和测试组(P=0.0021)中,高风险组患者的总生存期明显短于低风险组的患者。结论:本研究构建了胃癌的ceRNA调控网络并对网络中的基因进行了预后分析。此外,我们利用4个免疫基因构建了胃癌的免疫预后模型。我们的研究为胃癌的预后评估提供了新的生物学标志物。
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目的:肺癌的发病率在全球名列前茅,并且它的死亡率在中国乃至全球癌症患者中首当其冲。其中患非小细胞肺癌的病人占肺癌患者总数的八成以上。近几十年来内外科治疗非小细胞肺癌的手段不断发展,形成了以微创外科手术治疗为主的治疗体系,但总体疗效仍不理想。人类癌症的发生和进展与免疫功能相关,但与免疫相关的差异表达基因在肺癌组织及癌旁组织中的特性和意义尚不清楚。本实验旨在探讨免疫相关差异基因对非小细胞肺癌预后的影响
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目的:全球癌症数据统计表明胃癌是当今世界最常见的肿瘤之一,发病率居世界第五位,死亡率居世界第四位。早期胃癌5年生存率接近90%以上,而晚期胃癌5年生存率往往只有20%-40%。由于胃癌起病隐匿,绝大多数患者一经确诊就已处于进展期。胃癌是一种高度异质性肿瘤,患者从化疗、放化疗、靶向治疗以及免疫治疗等方式当中获益非常有限。因此,进一步探索胃癌发生发展中的关键分子机制,了解胃癌的分子异质性,寻找在胃癌中
目的:研究体成分指标与结直肠癌(Colorectal Cancer,CRC)发生及患者营养状况的关系,为今后制定结直肠癌的防治措施及结直肠癌营养状况评估提供理论依据。方法:本研究采用病例对照研究设计,选取2018年6月至2019年1月在中国医科大学附属第一医院肿瘤外科、胃肠外科和肛肠外科住院的194例CRC患者作为病例组。选择相同时期内按年龄、性别、城乡和病例组匹配的康复保健科、体检中心的286例
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