砖红绒盖牛肝菌三个发育阶段的差异表达基因筛选及其功能初步分析

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砖红绒盖牛肝菌(Xerocomus spadiceus)在云南分布广,经济价值高,深受人们喜爱。其隶属于真菌界(Fungi)、担子菌门(Basidiomycota)、伞菌纲(Agaricomycetes)、牛肝菌目(Boletales)、牛肝菌科(Boletaceae)、绒盖牛肝菌属(Xerocomus)。它不仅味道鲜美,兼具抗氧化、抗肿瘤等药用功效。牛肝菌属于外生菌根真菌,与植物共生,其室内纯培养条件下诱导的菌丝体生长缓慢,不会扭结原基,这是人工培养的症结所在。本实验室已能诱导出砖红绒盖牛肝菌小原基,因此本文以该菌种为研究材料,结合前期的转录组测序数据,对其菌丝体、原基、子实体三个发育阶段的差异基因进行分析;通过单样、复合样的多重比较,优选32条差异基因;在此基础上,最终选择3条上调表达基因,利用RT-qPCR技术分别检测其在培养8天、15天的菌丝体、原基中的表达量,并结合它们的数据库功能注释结果预测三个基因在菌丝生长、原基及子实体发育中的作用。这为进一步确定参与原基、子实体形成的候选基因,为子实体发育相关调控基因及其功能的研究奠定基础。主要结果如下:1.对于子实体-vs-原基的差异表达基因集,选取的c20382.graph-c1基因(命名为xs-lectin),上调表达,Pfam数据库注释为真菌凝集素基因;以gapdh基因为内参,RT-qPCR分析表明,培养8天及15天的原基,xs-lectin的相对表达量分别为子实体的675.6、137.2倍;推测该基因参与原基的形态建成。2.选取的c18954.graph-c1基因(命名为xs-hyd 1),在子实体-vs-菌丝体、子实体-vs-原基体的差异表达基因集中,均上调表达,Pfam数据库注释为疏水蛋白基因;以gapdh基因为内参,RT-qPCR分析表明,培养8天及15天的菌丝体,xs-hyd1的相对表达量分别为子实体阶段的207.9、26倍,培养8天及15天的原基,xs-hyd1的相对表达量分别为子实体的337.8、6.5倍,8天时菌丝体及原基的表达量相对较高;推测该基因在菌丝诱导、生长及原基形态建成时都被启动。3.选取的c22444.graph-c7基因(命名为xs-hyd 2),在子实体-vs-菌丝体的差异表达基因集中,上调表达,Pfam数据库注释为疏水蛋白基因;RT-qPCR分析结果,培养8天及15天的菌丝体,xs-hyd 2的相对表达量分别为子实体的5404.7、548.7倍;该基因在菌丝体诱导、生长阶段高表达,推测其与菌丝体生长相关。
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