近年来，电子商务由前期高速发展阶段进入成熟稳定阶段，线上红利边际收益减小，电商行业逐步实现规范化，转而开启了收割流量红利的运营模式。合作与共赢一直是零售行业制造商与零售商时刻关注的重点，然而上游供应商却往往被忽略；渠道的主导控制权结构直接影响着上下游之间协调冲突的方式；随着线上渠道的广泛扩展并开始占据传统渠道的市场，必然使得渠道成本增加，这时已不能忽略渠道成本对定价决策的影响了。本文综合考虑以上三个因素展开研究。　　本文构建由一个零售商、一个制造商以及一个供应商组成的三级供应链，创新性的考虑了渠道成本，引入双渠道供应链中，以渠道协调的方式对供应链管理运作中的冲突现象做了分析。首先对传统单一渠道的三级供应链的协调进行研究，然后针对制造商和零售商对渠道的控制能力不同，分成2种不同主导控制结构的双渠道供应链，系统分析如何进行决策，协调冲突。具体解决了以下三方面问题：采用博弈思想和系统优化的思路，构建了三级供应链系统的利润模型，研发了能够协调三级供应链成员间利益冲突的契约机制，对传统单一渠道三级供应链实现了协调；在制造商控制线上销售渠道，零售商主导线下销售渠道的情形下，对制造商主导的双渠道三级供应链实现了协调；对供应链系统中零售商占主导控制地位的双渠道三级供应链实现了协调，以上三种模型都能重新分配系统成员间的利益，实现系统整体收益最大。在对以上三方面进行理论研究后，均进行了数据仿真分析实验，验证了结论的有效性。