胰腺癌蛋白质组研究及DPC4抑癌基因对胰腺癌细胞系蛋白质组的影响

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细胞的生命活动涉及多种蛋白质表达量的动态变化、激活状态、蛋白之间相互作用等等,是一个十分复杂的生化过程。因此,在基因组计划研究完成之后,生命科学的研究方向不可避免地从基因向蛋白质领域转变。新兴的蛋白质组术通过双向电泳技术,使细胞的总蛋白(混合物)根据等电点和分子量的差异,在聚丙烯酰胺凝胶上清晰地展示出来,然后以计算机图像识别和分析技术,对这些蛋白质点进行扫描、存贮、编辑、对比、分析,再以各种物理的或生化方法(主要是生物大分子的电离质谱技术)对胶上的蛋白点进行处理,得到数据之后,通过各种蛋白质数据查询(生物信息学),使蛋白质得到鉴定。通过蛋白质组术,某种组织或细胞内蛋白质的组成、表达的量、修饰情况以及各种外因引起的蛋白质动态变化结果均可以显示出来。因此,蛋白质组技术是对组织总蛋白进行分离、展示、比较、鉴定及分析的有力工具,目前已经广泛应用于肿瘤病理学、心脑血管疾病以及药物研发等各个领域中。 建立某种组织的蛋白质双向电泳数据库是蛋白质组研究的基础工作。通过对正常及肿瘤组织蛋白质组的对比分析,可以找出二者之间差异表达的蛋白,对这些蛋白进行深入研究,有可能发现用于早期诊断、估计预后的标志或药物、免疫治疗的靶向蛋白。目前,国际上已经启动了乳腺癌、结肠癌、膀胱癌等大型的蛋白质组研究项目,并建立了相应的双向电泳数据库。但尚未见有胰腺癌蛋白质组研究的报道。 本研究应用蛋白质组技术,对12例病人的胰腺癌组织及癌旁正常胰腺组织进行了蛋白质分离和鉴定。在胰腺癌中,共鉴定出153种不同的蛋白,在正常胰腺组织中,鉴定出了167种蛋白。这些蛋白在双向电泳凝胶上的位置已被标出。通过肽段指纹图谱数据库查询,每种蛋白的名称、索引号、与数据库相匹配的片段及数目、蛋白的分子量、等电点、每个匹配片段的详细情况、肽段的被修饰情况(如半胱氨酸的烷基化、甲硫氨酸的氧化)等均记录在案。这项工作仍在继续进行中,相信将来会有更多的质白点被鉴定出来,为今后胰腺癌的蛋白质组研究打下良好的基础。
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