一个回族全面性癫痫家系的致病基因定位及突变筛查研究

来源 :兰州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huangyl1988
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研究目的:对一个来自甘肃地区的全面性癫痫家系进行致病基因定位及突变筛查研究。研究方法:收集到一个来自甘肃地区的全面性癫痫家系,对家系内所有患者进行临床资料采集(包括详细的病史询问、神经系统专科查体及头颅MRI、脑电图等相关检查)。通过连锁分析及单体型分析,全基因外显子组测序,候选基因一代测序验证确定该家系的致病基因。研究结果:该家系共有成员20人,患病者9例,现存患者8例,均表现为全身性强直阵挛发作,起病年龄为15岁,中位年龄2.5岁,呈常染色体显性遗传,病情呈逐代加重的趋势。应用常见的551个癫痫致病基因panel筛选了2个候选基因突变,分别为KCNH5(c.2621G>A,p.R874H)和KCNMA1(c.153155del,p.5152del),经过一代测序验证,无疾病表型共分离现象,不符合常染色体显性遗传,因此排除了这2个候选基因突变为该癫痫家系的致病基因。进一步通过家系连锁分析在2、3、22号染色体上均得到了LOD值大于2的SNPs,最高LOD值为2.1069。单体型分析将该家系的致病基因区间定位于chr2(rs9288624至rs10192318)约3485212 bp的区间内、chr3(rs9881421至rs1021662)约768064 bp的区间内、chr22(rs9628037至rs11090865)约3177116 bp的区间内。结合全基因外显子组测序结果,通过生物软件分析数据,筛选出4个候选基因突变,分别是MA P3K13(c.320G>A,p.Gly107Glu)、DGKG(c.2042G>A,p.Arg681Gln)、TTLL1(c.986C>T,p.Ala329Val)和PNPLA5(c.853C>T,p.Arg285Cys)。研究结论:本研究通过家系连锁分析、全基因外显子组测序技术得出4个候选基因突变MAP3K13(c.320G>A,p.Gly107Glu)、DGKG(c.2042G>A,p.Arg681Gln)、TTLL1(c.986C>T,p.Ala329Val)和PNPLA5(c.853C>T,p.Arg285Cys),该家系的致病基因很可能就是这4个候选基因中的其中之一。
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