翘嘴鳜微卫星亲子鉴定及遗传多样性分析

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翘嘴鳜(Siniperca chuatsi),又称鳜鱼、桂花鱼,属鲈形目(Perciformes),鮨科(Serranidae),鳜亚科(Sinipercinae),鳜属(Siniperca),是中国特有的淡水经济养殖鱼类。自鳜鱼人工繁殖成功之后,鳜鱼的人工繁殖发展越来越快,成为了淡水养殖业中优质的品种。由于近年来人类乱砍乱伐、工农业排放污水、江河过度捕捞,翘嘴鳜的生存环境变得非常恶劣,鱼类种群数量不断减少;在翘嘴鳜的繁育过程中,由于个体间近亲杂交严重,导致鳜鱼种质不断退化,抵抗力减弱、生长速度明显降低,已经严重影响了翘嘴鳜养殖业的正常发展。为了解决目前鳜鱼近亲繁殖问题和保护鳜鱼种质资源,有必要从分子遗传学的角度对鳜鱼进行遗传多样性研究。本文首先设计并筛选出20个微卫星多态引物,建立翘嘴鳜的全同胞家系并利用10个微卫星多态引物进行亲子鉴定分析,并对江苏省六个翘嘴鳜群体进行遗传多样性分析。在亲子鉴定的实验中,亲本分别来自骆马湖和高邮湖,一对一配对,构建5个鳜鱼的全同胞家系,每个家系取10尾子代,共50尾子代,选取筛选的10个微卫星标记对子代及亲本进行亲子鉴定,用popgene32和Cervus软件进行遗传多样性分析和亲权分析。遗传多样性分析表明,10个微卫星标记上的平均等位基因为6,平均观测杂合度为0.7733,平均期望杂合度为0.8211,平均多态信息为0.7875。通过检测微卫星位点排除概率可知,当双亲基因型未知时,单个微卫星位点的排除率(E-1P)在0.39-0.517之间,平均排除率为0.453,10个微卫星位点的累积排除率为0.997;当单亲的基因型已知时,单个微卫星位点的排除率(E-2P)在0.57-0.686之间,平均排除率为0.629,累积排除率为0.999;一对亲本组合的亲权排除率在0.749-0.854之间,平均值为0.805。模拟分析表明,该研究所用的10个微卫星位点适用于所有情况下的50对候选亲本和亲本对(性别已知)情况下的100对候选亲本;当双亲未知时,为达到95%以上的鉴定率,至少需要7个微卫星位点。在进行亲权鉴定时,50尾子代个体都找到了各自的亲本,鉴定率为100%,表明了这10个微卫星位点能够应用于翘嘴鳜的亲子鉴定。在种群遗传多样性实验中,通过收集江苏省6个鳜鱼群体来进行江苏省鳜鱼种群资源的遗传多样性分析。用筛选出的20个微卫星标记对6个鳜鱼群体进行遗传多样性分析,在20个微卫星位点中总共获得842个等位基因,每个位点的等位基因为5-9个,且6个鳜鱼群体在每个位点上都表现出了多态性。其中长江鳜鱼群体的平均有效等位基因为6.5248、平均期望杂合度为0.922、多态信息含量为0.8273,在六个鳜鱼群体中最高,相反,太湖鳜鱼群体的平均有效等位基因为4.8623、平均期望杂合度为0.8369、平均多态信息含量为0.7619,在六个鳜鱼种群中最低。鳜鱼微卫星位点的G-统计分析表明,鳜鱼群体间存在轻度的近交现象。鳜鱼群体之间的遗传距离和遗传相似度结果表明,太湖鳜鱼群体和滆湖鳜鱼群体遗传分化程度最低,亲缘关系最近;骆马湖鳜鱼群体和太湖鳜鱼群体遗传分化程度最高,亲缘关系最远。UPGMA聚类分析表明,高邮湖和洪泽湖鳜鱼群体聚为一类,太湖和滆湖鳜鱼群体聚为一类。本研究通过对鳜鱼的亲子鉴定及江苏省鳜鱼群体的遗传多样性分析,为遗传图谱的构建奠定了基础,为家系选育提供了理论依据和技术手段,对江苏省鳜鱼种质资源的保护具有重要意义。
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