本文采用结合变形梯度凝胶电泳DGGE和克隆文库技术的分子生物学手段，对牡丹江流域的水节霉爆发的水环境沉积物和水节霉共生体，细菌和真菌群落结构作了比较和分析。并采用MEGA等作图软件和香侬-威纳等所养性指数对沉积物样品和共生体样品进行了微生物多样性的评估，得到了以下结论。　　 1．获得了576条有效序列，共得到细菌类群如下Acidobacteria（酸杆菌门）,Planctomycetes（浮霉菌门）,Actinobacteria（放线菌门），Betaproteobacteria(Beta-变形菌门），Alphaproteobacteria（Alpha-变形菌门），Deinococcus –Thermus（异常球菌-栖热菌门）,Firmicutes（厚壁菌门）,Gemmatimonadetes（芽单胞菌门），Deltaproteobacteria（Delta-变形菌门）,Cyanobacteria（蓝藻门）Chlorobi（绿菌门）,Chloroflexi（绿弯菌门）真菌类群如下Basidiomycota（担子菌门）Ascomycota(子囊菌门),Blastocladiomycota，Chytridiomycota（壶菌门）,Cercozoa（丝足虫类）,Zygomycetes（接合菌门）及其他类群Choanoflagellida和Rhodophyta（红藻门）.　　 2．构建了12个克隆文库和一个DGGE分析谱图，从直观角度将水节霉爆发地的微生物群落展现出来。并用多样性指数，分析和讨论影响水节霉生长繁殖的环境因素和共生体的微生物群落变化。