利用微卫星DNA标记分析七品种(类型)小型猪的遗传多样性

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采用世界粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)联合推荐的27对微卫星引物,检测了七个中国地方小型猪种(类型):久仰香猪、剑白香猪、从江香猪、环江香猪、香猪(贵州省罗湾种猪场)、五指山猪、滇南小耳猪及三个外来猪种:杜洛克、大白猪、长白猪共计558个样品的基因型,通过计算等位基因频率、遗传杂合度、多态信息含量、奈氏遗传距离和奈氏标准遗传距离,分析品种内和品种间的遗传变异;采用邻近结合法及非加权组对算术平均法,进行聚类分析,结果表明: 1.在23个微卫星座位中,所有位点的平均等位基因数均大于5,最小平均等位基因数出现在位点SW951,为5.1,最大平均等位基因数出现在位点CGA,为15.4,从品种角度分析,五指山猪的平均等位基因数最高,四类型香猪(久仰、剑白、从江及环江)的平均等位基因数最低,在23个微卫星位点上的平均等位基因数均不大于5。 2.7个国内地方猪种(类型)的平均多态信息含量(PIC)在0.61~0.84之间,国外猪种的平均多态信息含量(PIC)在0.47~0.68之间,差异显著性检验(T检验)表明:国内五指山猪、香猪(贵州省罗湾种猪场)、滇南小耳猪与三个外来猪种:杜洛克、大白猪、长白猪差异显著(P<0.05)或极显著(P<0.01),久仰香猪、剑白香猪、从江香猪、环江香猪与外来猪种间差异显著(P<0.05)或不显著(P>0.05)。 3.7个国内地方猪种(类型)的平均杂合度在0.6679~0.8640之间,剑白香猪最小,为0.6679,五指山猪最大,为0.8640,国外猪种的平均杂合度在0.4585~0.7169之间,大白猪最小为0.4585,杜洛克最大,为0.7169。 4.结合平均多态信息含量及平均杂合度两个指标,10品种(类型)猪的变异程度从大到小依次为:五指山猪、香猪(贵州省罗湾种猪场)、滇南小耳猪、杜洛克、环江香猪、从江香猪、久仰香猪、剑白香猪、长白猪及大白猪。 5.采用微卫星分析品种间的变异程度时发现,中国猪种和外来猪种间的遗传距离较大,相对大白猪和长白猪而言,杜洛克与中国地方猪种的遗传距离较近,中国地方猪种同一省份猪种间的遗传距离较小,不同省份猪种间差异较大。 6.根据奈氏遗传距离及奈氏标准遗传距离,绘制了10品种(类型)猪的NJ及UPGMA聚类图,结果显示:10品种(类型)猪共分为3大类群,久仰、剑白、从江及环江香猪聚为第一类,滇南小耳猪、五指山猪、香猪(贵州省罗湾种猪场)聚为第二类,国外猪种聚为第三类;久仰、剑白、从江及环江香猪单独聚为一类,和其余猪种遗传距离较远,说明四类型香猪有独特的遗传结构。
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