利用20个微卫星标记对9个地方鸡种进行遗传多样性分析，根据等位基因频率、多态信息含量、杂合度、有效等位基因数、遗传距离和聚类结果，评估各品种内的遗传变异和各品种间的遗传相关。结果表明如下： 9个地方鸡种在20个微卫星座位中共检测到168个等位基因，其中43个等位基因为所有品种共有，19个稀有等位基因为品种所特有。在位点中，不同座位上的等位基因数在6～12之间。平均每个座位上等位基因数为8.4个。在品种中，品种拥有的等位基因数在85～121，平均每个品种的等位基因为99.4个。 20个微卫星座位在9个地方鸡种中的平均多态信息含量为0.6049(0.4294～0.7282)，其中MCW32的平均多态信息含量最高为0.7282，ADL123最低为0.4294。各位点平均有效等位基因数的范围为2.2-4.8。 9个地方鸡种在20个微卫星座位中的平均基因杂合度为0.6695(0.6388～0.6980)，其中溧阳鸡的平均杂合度最高为0.6980，狼山鸡的最低为0.6388。 9个地方鸡种间的平均遗传距离为0.4319(0.1418～0.5687)，其中淮北麻鸡和淮南三黄鸡之间的遗传距离最近为0.1418，漳州斗鸡和淮南三黄鸡之间的遗传距离最远为0.5687。 9个地方鸡种被聚为4类，1类：淮南三黄鸡、淮北麻鸡、桃源鸡和大骨鸡聚为一类；2类：寿光鸡、溧阳鸡和狼山鸡聚为一类；3类：丝羽乌骨鸡独自为一类；4类：漳州斗鸡独自为一类。 本研究结果可为我国地方鸡种的种质特性研究提供基础数据，为地方鸡种资源的合理保护和利用提供科学依据。