microRNA-106在胃癌中的诊断作用及其功能的生物信息学分析

来源 :苏州大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:maly_soly
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目的:近年来,越来越多的证据表明,microRNA-106(miR-106)可能是胃癌诊断中的一种无创、经济的生物标志物。然而,研究间的不一致结果阻碍了其在临床实践中的应用。因此,我们进行了全面的meta分析,评价了用于胃癌诊断的miR-106和miR-106相关组合标志物的诊断效能。同时,我们也对miR-106在系统生物学水平上的功能进行了全面的生物信息学分析。方法:基于 PubMed、EMbase、Web of Science 和 Cochrane Library 等数据库,检索公开发表的评价miR-106与胃癌诊断相关的文献。由2名研究者按纳入和排除标准独立选择文献、提取资料和评价质量。应用STATA(14.0版本)和Meta-DiSc(1.4版本)统计软件进行分析。此外,我们通过对miR-106的靶基因进行基因本体论和KEGG通路分析,构建miR-106靶基因的蛋白相互作用网络,鉴定网络节点基因和重要模块等生物信息学方法探讨miR-106系统生物学层面上的功能,探究它们与胃癌发生发展的关系。结果:我们的研究最终纳入了 10篇已发表的文章,包括12个单独针对miR-106的研究和5个针对miR-106相关组合标志物的研究。研究结果表明单独miR-106对胃癌诊断的敏感性为0.71(95%CI:0.65-0.76),特异性为0.82(0.72-0.88),AUC(曲线下面积)值为0.80(0.76-0.83)。特别的是miR-106相关组合标志物提高了联合诊断效能,其敏感性、特异性和 AUC 分别为 0.78(0.65-0.87)、0.83(0.77-0.89)和 0.88(0.85-0.90)。亚组分析表明,样本类型和样本大小可能影响诊断的准确性。此外,我们搜集了miR-106的靶基因,通过基因本体论和KEGG通路分析揭示了它们与胃癌发生发展的关系。从miR-106靶基因构建的蛋白相互作用网络中鉴定出了关键的节点基因和重要的网络模块,发现它们也与胃癌的发生和发展密切相关。结论:miR-106可能作为诊断胃癌的生物标志物,并且miR-106相关组合生物标志物可能为临床应用提供新的选择。
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