乙型肝炎是严重威胁人类健康的疾病之一。乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus, HBV)是导致急慢性肝炎、肝硬化和肝癌的主要原因。10种基因型和48种亚型是HBV病毒多样化的显著体现,HBV的多类型给乙型肝炎的基础研究和临床治疗带来巨大挑战。本文借鉴数据挖掘领域的决策树分类方法,并结合传统系统进化分析方法,对HBV临床数据进行了基因型和亚型分类。对我国乙型肝炎病毒系统进化演变的研究有助于了解乙型肝炎病毒的发病机制,并对临床治疗提供指导依据。本文的主要研究内容如下：对HBV临床数据和公共参考数据进行统一化处理,获得便于分析的全基因组和X/PreC基因(nt1374-nt1900)。在此基础上,对HBV序列进行关键信息位点的挖掘,并根据得到的位点构建B1-B10亚型的决策分类树。在多序列比对的基础上,构建A-Ⅰ型X/PreC基因的系统进化树,研究B类亚型与其他基因型间的进化关系；构建B1-B10全基因组的系统进化树,研究它们之间的进化关系。通过系统进化分析,验证了西双版纳地区哈尼族人群中存在的HBV新亚型B10。将基于离散信息位点的分类结果与基于序列相似性构建的系统进化树进行一致性分析。并使用Genotyping工具对新亚型的重组基因结构进行分析,发现了新亚型的B/C重组结构,这一特点在该地区的哈尼族中属首次发现。此外,本文还对HBV原始序列及其分类标准的合理性进行了一些讨论。文章的实验结论对HBV系统进化理论作出了补充,并且对云南省少数民族聚居地区HBV的研究具有一定价值。