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在人类单位点致病基因与遗传标记基因的遗传连锁分析中，家系是应用得最普遍的一种群体结构。在家系遗传连锁分析中，通常将任意一对二倍体个体所携带的标记基因间的同源性(identity)作为他们之间关于该遗传标记基因座的遗传相关性测度，例如多数基于患病同胞对(affected sib pair，ASP)的遗传连锁分析方法；基于父母双亲及一患病子(女)的遗传连锁不平衡的检验方法(transmission/disequilibrium test,TDT)；基于病例家系成员的遗传连锁分析方法IBD-APM。但是判断等位基因间的同源性是非常困难的。 本文旨在将遗传连锁分析建立在具有遗传关系的亲属对所携带的标记基因的基因型这一遗传相关性测度之上，利用Pearson X~2统计量去检验疾病基因座与标记基因座间的遗传连锁，并且用随机模拟的方法分析了该检验的Power。 本文的第二章是全文的基础，第二章给出了考虑两连锁基因座位时，任一具有遗传关系的亲属对(诸如父子、同胞、祖孙等)基因型的联合分布模型。此模型推广了C.C.Li(1954)给出的单基因座位任一具有遗传关系的亲属对基因型的联合分布模型。