【摘 要】
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背景和目的:急性淋巴细胞白血病(Acutelymphoblasticleukemia,ALL)是起源于淋巴细胞的骨髓内异常增生性恶性肿瘤,是儿童常见的恶性肿瘤。随着诊疗方法的改进,ALL患者的疗效有所改善,但骨髓外复发常常难以避免,其中中枢神经系统(Centralnervoussystem,CNS)是最常见的复发部位,是影响ALL疗效的主要原因之一。目前的治疗儿童中
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背景和目的:急性淋巴细胞白血病(Acutelymphoblasticleukemia,ALL)是起源于淋巴细胞的骨髓内异常增生性恶性肿瘤,是儿童常见的恶性肿瘤。随着诊疗方法的改进,ALL患者的疗效有所改善,但骨髓外复发常常难以避免,其中中枢神经系统(Centralnervoussystem,CNS)是最常见的复发部位,是影响ALL疗效的主要原因之一。目前的治疗儿童中枢神经系统白血病(Centralnervoussystemleukemia,CNSL)的方案对儿童副作用大及治疗后易再次复发。研究儿童ALL中枢神经复发的机制,为寻找CNSL治疗的新靶点具有重要意义。随着新一代全基因组与转录本测序技术的到来,可对基因表达谱、DNA拷贝数变化及表观遗传学改变进行高通道全基因组分析,并因此建立的公共数据库,为白血病的深入研究提供了很好的平台。本研究旨在通过TARGET(TherapeuticallyApplicableResearchToGenerateEffectiveTreatments)数据库,利用生物信息学相关分析方法,寻找可预测儿童ALLCNS复发有关的生物标志物,并建立预测模型,为ALLCNS复发高风险儿童患者进行早期预防及靶向治疗,以期阻止或延缓其出现CNS复发提供理论依据。方法:从TARGET数据库下载COG(TheChildren`sOncologyGroup)协作组收集的儿童ALL项目phaseII的转录组及对应的临床资料数据,通过生物信息学方法分析转录组数据确定核心(hub)基因,进行cox单因素及多因素分析,采用后退逐步法纳入目标基因建立最优模型并计算风险值。对各临床资料分别进行单因素cox分析,并将其得到的有统计学意义的临床单因素结果和风险评估模型获得的风险值进行多因素cox回归分析,确定生物标志物。最后利用TARGET数据库中COG协作组收集的儿童ALL项目phaseI的样本进行验证。结果:本研究根据是否出现CNS复发,将收集到的TARGET数据库ALL项目phaseII数据分成CNS复发组与非复发组。筛选出CNS复发组与非复发组差异基因共1230个,GO富集分析表明,这些差异基因主要参与抗原加工和递呈、细胞迁移与增殖的正向调节、T细胞聚集、血管生成、细胞粘附等生物学过程;参与各种细胞膜、MHCII类蛋白质复合物的组成;表达的分子具有MHCII类受体活性、生长因子活性、信号转导活性、钙调素结合活性等功能(p
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