基于微流控芯片的30种皮肤型HPV分型检测研究

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:luluzhangwei
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目的: HPV与多种皮肤黏膜疾病相关,其中包括良性和恶性的增生病变。可引起数种皮肤型疾病,例如良性皮肤疣,日光性角化病和非黑素瘤皮肤癌。在健康人的皮肤上也常常检出皮肤HPV型别,不同的HPV型别引起的疾病及预后情况不同,且HPV的感染具有显著的地域差异,通过对本地区患者HPV感染型别的检测,结合对治疗效果的分析,从而对推动皮肤疣个体化治疗方案的实施及研制特异性的HPV病毒基因预防性疫苗提供分子流行病学依据。但是目前绝大部分的HPV检测方法是针对黏膜型HPV,缺乏一种成熟的可应用于临床的皮肤型HPV检测方法,针对上述存在的问题,本课题旨在研究一种用于皮肤型人乳头瘤病毒(HPV)分型检测的检测体系,这一检测体系灵敏度高,特异性强,可检测的型别多且全,能够满足临床上对皮肤型HPV分型检测的需要。  方法:设计并筛选LAMP反应引物,对各型别HPV的L1区段进行对比,选取差异较大的部分进行设计LAMP反应引物,每一型别各设计四组不同的引物,筛选出扩增速度快、无非特异性扩增的一组引物;将30种HPV型别按照皮肤低危型、皮肤高危型和皮肤罕见型分为5个小组,每6个型别为一小组,皮肤低危型别组由3个小组组成,皮肤高危型别组及皮肤罕见型别组各1个小组,特异性验证在各组内进行,保证每小组内各HPV型别之间特异性较好的基础上,尽量保证小组组间特异性,并将小组组间交叉反应型别控制到最小。对筛选出来的HPV型别引物进行灵敏性检测,将各型别HPV DNA质粒溶液分级稀释为108copies/μl,107copies/μl,106copies/μl,检测出该体系最低可检测出的样本质粒DNA浓度。  使用新构建的HPV检测体系检测临床样本的HPV具体型别,并统计数据。使用PCR测序法作为对比,PCR技术属核酸扩增法,可作为病毒检测分型的黄金标准,使用PCR测序法检测临床样本的HPV具体型别,统计数据,并将结果与LAMP检测的结果进行对比,得出新构建的皮肤型HPV检测体系的特异性和灵敏性。  结果:5个小组组内HPV型别均无交叉反应出现,特异性佳,皮肤低危型别中3个小组间特异性检测结果,其中HPV2引物可被HPV3质粒DNA扩增,HPV3引物可被HPV125质粒DNA扩增,HPV75引物可被HPV76质粒DNA所扩增,其余皮肤低危组HPV型别小组间均无交叉反应,特应性佳。30种HPV型别引物均在质粒DNA溶液为107copies/μl时产生扩增反应,出现阳性结果,可以得出该检测体系的灵敏性为可检测的病毒DNA浓度最低达107copies/μl。  将PCR测序法作为黄金标准,对比两种检测方法的样本检测结果,可以得出新构建的HPV型别检测法中检测HPV27、HPV2、HPV1、HPV57、HPV3、HPV4、HPV7及HPV75型别的灵敏性均为100%,特异性分别为60.4%,64.5%,96%,98.6%,97.7%,96.6%,98.8%及98.8%,其中一例PCR测序法检测结果为HPV11,超出新构建的HPV检测体系的检测范围,不予以分析,将单一感染型样本单独进行分析,对比两种检测方法,可以得出新构建的HPV检测体系检测HPV27、HPV2、HPV1、HPV57及HPV7型别灵敏性均为100%,特异性分别为72%,90.6%,100%,100%及96.7%。将可被PCR测序法检测出HPV型别的单一感染型样本单独进行分析,对比两种检测方法,可以得出新构建的HPV检测体系检测HPV27、HPV2、HPV1及HPV57型别灵敏性和特异性均为100%。  结论:本课题新构建的皮肤型HPV检测体系初步构建完成,该体系具有高灵敏性及高特异性的特点,结合其低成本、高通量及操作快速简单的特点,满足了临床检测的需要,弥补了皮肤型HPV检测这一领域的空白。
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