医药产业作为南昌市重点规划的十大战略产业，在政府的引导与社会各方的支持下，通过集群化发展战略，逐步实现了医药产业的快速发展。在医药产业集群发展过程中，区域物流的发展水平成为影响产业集群发展的重要因素。因而发挥区域物流与医药产业集群的协同增益作用，是实现南昌医药产业集群与区域物流可持续发展的关键所在。本文首先通过选取南昌医药产业集群和区域物流发展的序参量，分别对二者的有序度进行分析，借鉴容量耦合概念，构建南昌医药产业集群与区域物流的协同度模型。其次，通过对2005年-2011年数据的分析，得出南昌医药产业集群和区域物流发展的有序度在不断提高，协同度也呈逐年上升的态势，正在从初级的协同阶段向更高级的阶段发展。最后针对结论，提出如何促进南昌医药产业集群与区域物流向更高级阶段协同发展的对策。