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中国是世界著名的养驴大国,驴产资源丰富,生态类型多样,但其种质特性和品种间遗传关系研究报道很少,特别是在分子水平上的相关研究。本研究以中国大、中型驴种为研究对象,分析了29对微卫星在这些品种中的遗传变异及这些品种的群体遗传结构;并测定和分析了驴的生长激素基因序列。 一、利用马基因组中筛选出的29对微卫星分析中国大、中型驴种的群体间和群体内遗传变异,并探讨了29对微卫星在中国大、中型驴的遗传变异,结果表明: 1.本研究采用马的基因组中42对微卫星对中国大、中型驴8个品种的基因组进行扩增,其中29对扩出了清晰的条带,且产生了丰富的多态性,可用于驴的遗传多样性分析。 2.29对微卫星对8个中国大、中型驴种遗传多样性分析表明,每个座位检测到的等位基因数为5～14个;每个群体检测到的等位基因数为2～13个,在8个品种中检测到的等位基因数为261个,其中有9个私有等位基因;微卫星基因座NVHEQ18为中度多态(0.335),其余全为高度多态,并且有20个微卫星PIC均大于0.7,可用于遗传连锁分析;每个微卫星座位的平均有效等位基因数为1.66～5.67个;等位基因丰度为4.681～9.985个;平均多态信息含量为0.335～0.818;总体杂合度(H_t)为0.384～0.849;种群内平均杂合度(H_s)为0.359～0.843;平均观察杂合度(H_o)为0.111～0.548;LEX003平均等位基因数和基因丰度最大,TKY321最小;PIC、Ht和Hs值为UCDEQ505最大,NVHEQ18最小。在8个驴品种中,晋南驴具有最高的多态信息含量和平均杂合度,德州驴具有最高的有效等位基因数;淮阳驴具有最低的多态信息含量、平均杂合度和有效等位基因数。 3.群体遗传结构分析表明,绝大多数种群在各基因座上的基因型偏离Hardy-Weinberg平衡。连锁不平衡检验表明,除个别种群的个别微卫星基因座组合外,位于同一条染色体上的7组微卫星,在整个群体中除HMS7和ASB41处于连锁不平衡外,其余已经确定在同一染色体上的微卫星座位均处于连锁平衡状态;而在不同染色体上的基因也存在连锁不平衡。在TPM模型下,根据Wilcoxon符号-秩两尾检验表明,