21种雀形目鸟类细胞色素b基因序列分析及其系统发育研究

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 8次 | 上传用户:zhushuangwu1999
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雀形目鸟类是鸟纲中最大的一个类群,在自然界中有着广泛的适应辐射,有关该类群的起源以及各科演化关系,一直是鸟类学研究中争论的主要问题之一。在系统学研究上,由于分子系统学所具有的优势,近些年来,越来越多的人应用分子系统学的方法进行鸟类系统发育研究。本研究应用DNA序列分析的方法,测定了雀形目21种鸟类线粒体细胞色素b基因部分序列,并利用软件对序列进行分析,构建了系统树,结果表明: 1.在沼泽山雀(Paruspalustris)中可能存在核内线粒体假基因(Numts),而在灰背鸫(Turdushortulorun)和煤山雀(Parusater)中扩增出的异常片段是否为核内线粒体假基因还有待进一步研究。 2.细胞色素b基因序列(455bp)的特点:T、C、A、G的平均含量为24.2%、32.2%、28.5%、15.1%,G+C含量为47.3%,密码子第三位的碱基使用存在严重的偏倚,密码子第三位碱基倾向于A或C(A+C含量为86.4%),而第三位碱基是G的概率最小(2.7%);核苷酸的变异主要是转换和颠换,且转换多于颠换,R平均值为1.5,其中密码子第一位R=2.3,第二位无颠换,全是转换,第三位R=1.3;同义密码子的使用存在偏倚;序列之间的平均遗传距离为0.176. 3.在科级系统关系上,认为燕雀类和鹀类的分歧达到了科级水平,支持将它们分别归入燕雀科和鹀科;支持将鹟类、鸫类、长尾山雀类、莺类和岩鹨类独立成科的观点;通过构建系统树,初步确定了科间的系统关系:((鹟科,鸫科),(((长尾山雀科,莺科),山雀科),(①(岩鹨科,(鹀科,燕雀科)))))其中①也是山雀科可能的位置,有待进一步研究。 4.在科下系统关系上,认为应在在燕雀科(Fringillidae)下设一新的亚科-锡嘴雀亚科(Coccothraustinae),与已有的燕雀亚科和金翅雀亚科平级。 5.根据相对速率检验,认为各主要分支的替代速率相同。并根据每百万年2%的进化速率推断出了各主要分支的大致分歧时间:燕雀科与鹀科的分歧时间在8.0百万年左右,鹟科和鸫科的分歧时间也在8.0百万年左右,长尾山雀科与莺科的分歧时间在9.3百万年左右。在燕雀科内部,锡嘴雀亚科和金翅雀亚科的分歧时间在7.3百万年左右。北朱雀和长尾雀的分歧时间在5.0百万年左右。而两个外群的分歧时间在12.4百万年左右。
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