论文部分内容阅读
褐牙鲆是我国北方重要的海水养殖鱼类,养殖规模较大。在养殖过程中常出现高比例的白化现象,白化褐牙鲆商品价值大大降低。许多学者采用饵料强化等方法降低褐牙鲆白化率,取得一定成效。但有关褐牙鲆白化相关基因的研究国内外未见报道。本研究采用mRNA差异显示方法分离褐牙鲆白化相关基因。以正常和白化牙鲆表皮组织总RNA为模板,用Oligo d(T)13M(M分别为A、C、G)3种锚定引物和26种差异显示随机引物组合进行差异显示,PAGE凝胶电泳后,用新型高灵敏度核酸荧光染料SYBR GREEN Ⅰ显示差异DNA条带,得到区分度较好的差异表达图谱,共分离49条牙鲆白化相关DNA片段,片段长度260~920 bp左右。对其中10条差异片段进行克隆测序,测序结果通过Internet与NCBI序列数据库进行同源性比较。结果发现2个片段与已知基因有较高的同源性,其余片段与已知基因无明显的同源性。Alb1核酸序列片段与斑马鱼类锌指蛋白216基因有较高同源性,其部分序列同源性达84%;用BLASTX软件将Alb1翻译为氨基酸序列进行同源性分析,结果进一步表明Alb1序列与人、鼠的锌指蛋白 216有很高的同源性。Alb2核酸序列与鼠的溶质载体蛋白基因家族1(solute carrier family 1)高度同源,部分序列同源性可达86%;这一结果也同样得到了BLASTX结果的证实。这两个基因可能与褐牙鲆白化现象有着密切的关系。同源性较低的片段可能为未知新基因,对这些序列信息进行进一步研究将有助于获得完整基因和了解褐牙鲆白化机制。