大学战略联盟是高校提升办学竞争力的重要举措之一,也是近年来我国高等院校开展校际合作的重要形式。高校以满足不同的目标和需求纷纷结成战略联盟,对于迅速提升自身办学效果和办学影响力等都有极大的促进作用。研究以协同学理论为基础,运用文献法、网络调研发、案例分析法、访谈法等对我国大学战略联盟运行机制进行了研究。研究发现:首先,序参量是自组织系统机制运行有序的表征,联盟机制有序的运作主要依赖联盟主序参量(项目合作)与其他序参量(目标、机构、制度)之间的有效协作;其次,通过对我国大学战略联盟的现状分析和案例分析,发现目前我国大学战略联盟的序参量基本不存在缺失的问题,但是序参量之间的协调存在一定的不匹配,尤其是主序参量与其他序参量之间,主要表现为:(目标)目标定位与项目合作计划存在偏差影响战略发展;(组织机构)项目协作管理部门不明确影响项目协作的广度和深度;(文本制度)文本制度不完善造成项目推进无章可循;(交流制度)缺乏针对项目合作而设立的交流渠道。针对目前我国大学战略联盟运行机制存在的问题,要促进联盟运行机制从无序到有序的转变,主要需要解决主序参量与其他序参量之间的不协调问题。本着该出发点,论文根据协同学相关观点,从项目合作应该与目标、机构、制度相协同为立足点,提出了促使我国大学战略联盟运行机制有序化的思考与建议:第一,明确的目标是推动大学战略联盟协同发展的前提;第二,健全职责明确的项目协同机构;第三,完善衔接有序的合作规章制度;第四,加强互通提升项目合作质量。