慢性肾病肌肉萎缩动物模型的建立及转录组图谱绘制

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慢性肾脏疾病(Chronic Kidney Disease,CKD)并非是某一种疾病而是一类肾病的集合,但目前国际上将慢性肾病定义为肾功能降低,肾小球滤过率(glomerular filtration rate,GFR)小于60 m L/min per 1·73 m2或标记物出现3个月以上的肾脏损害或两者兼而有之[1]。糖尿病和高血压是所有高收入和中等收入国家以及许多低收入国家CKD的主要原因。慢性肾病的发病率,患病率和死亡率在不同国家不同种族和不同社会而异,这其中导致慢性肾病发生的原因复杂,我们尝试从表观遗传的角度切入去探寻慢性肾病中复杂的机制[2]。慢性肾病进展过程中会有各种并发症随之而来,除了最常见的心血管疾病包括高血压,血管钙化,还有由于肾脏促红细胞生成素减少引起的贫血;红细胞生成减少和缺铁;由维生素D,钙和磷酸盐代谢紊乱引起的矿物质骨病(Chronic Kidney Disease–Mineral and Bone Disorder,CKD-MBD)和慢性肾病中晚期的肌肉萎缩[3-5]。慢性肾病中持续存在的肌肉蛋白分解代谢导致肌肉大量丢失,即便是很小但持久的蛋白质合成与分解失衡也会造成蛋白大量损失。患者中,细胞蛋白的丢失会增加病人肌肉萎缩的发病率和死亡率,但目前并没有可靠的方法去阻止慢性肾病介导的肌肉萎缩发生[6]。导致蛋白质消耗的分解代谢途径包括激活泛素-蛋白酶体系统(ubiquitin-proteasome system,UPS)、caspase-3、溶酶体和肌肉生长抑制素(骨骼肌生长的负性调节因子)[7]。慢性肾病相关的并发症可以激活这些途径,如代谢性酸中毒、胰岛素信号缺陷、炎症、血管紧张素II水平升高,食欲调节异常,micro RNA反应系统受损。炎症刺激细胞信号通路,产生肌生成抑制素,从而加速泛素-蛋白酶体系统(UPS)介导的分解代谢,阻断这一途径可以防止肌肉蛋白的丢失。抑制肌肉生长抑制素可能产生新的治疗慢性肾病及其并发症的方法[8]。为了进一步研究慢性肾病中肌肉萎缩的发生发展机制,以期找到合适的靶点来做进一步的预防和治疗,我们建立了慢性肾病的小鼠模型,以C57BL/6小鼠为背景,通过5/6肾脏切除的手术方式,在两周时间内分别完成两侧的手术操作,再经过后期高低蛋白饮食的调节,最终成功建立了慢性肾病肌肉萎缩的小鼠模型,这为我们后续的实验打下了坚实的基础。接下来我们收集了大量假手术组小鼠和对应手术组小鼠的胫骨前肌样本,经液氮速冻后保存于-80°C,后续分别进行免疫荧光染色、RNA和蛋白提取等实验。后期将小鼠肌肉中提取的RNA进行转录组学分析(RNA-Seq和Ch IP-Seq)从而找到可能影响肌肉萎缩进程的关键调控靶点。本研究从动物模型的建立起始,通过生物信息学的分析找到在表观遗传学上发生显著改变的靶点,后期再通过体内外相关实验验证。从而有助于我们更深刻的理解慢性肾病肌肉萎缩的发生发展机制,找到合适的靶点为后续靶向性药物治疗提供思路。
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