经济新常态下，我国正大力实施供给侧结构性改革，目的就在于降低成本，提高全要素生产率。同样，衡量产业与企业发展状况的标志也是全要素生产率的高低。提高全要素生产率有效途径是促进技术进步与制度创新。医药行业关系到人民的生活、健康，同时也与科技发展密切相关，具有良好的发展前景。对我国这样一个医药大国而言，如何早日从医药大国步入医药强国的行列具有重要意义。因此，如何提升我国医药产业的核心竞争力，使我国的医药产业由低端走向高端，完成产业的转型升级，促进我国医药产业的发展成为一个急需解决的问题。本文从制度环境入手，分析其对医药制造企业全要素生产率的影响，具有一定的理论意义和实践价值。　　本文从制度经济学出发，在进行相关文献综述的基础上，将制度环境细分为三个子项:市场化程度、产权保护水平和政府干预放松。梳理制度环境对全要素生产率的直接影响，以及其影响途径和内生与外生机制。利用区域层面的数据对制度环境与TFP之间的关系进行初步的检验，然后使用中国工业企业数据库中的医药企业面板数据对本文的研究问题进行计量检验。基于区域层面数据的检验中发现，制度环境的改善能够通过促进技术创新和产品创新从而提高全要素生产率，相比而言，产品创新对于全要素生产率增长的贡献更大，制度环境变量中，政府干预的放松能够最大限度的促进产品创新，从而提高全要素生产率。医药企业的计量分析结果显示，市场化程度的提升、产权保护水平的加强、政府干预的放松确实对于医药企业的全要素生产率具有促进作用。同时在进行机制分析时发现，制度环境的优化可以通过减少企业管理费用、增加企业利润、增加销售产值等途径，促进医药企业全要素生产率的提升;外部机制检验发现，市场化程度的提升、产权保护水平的加强、政府干预的放松对于区域外资投资水平和技术市场交易额增长具有不同的作用，且对其绝对值和相对值的作用各有不同，总体而言，市场化程度的提升、产权保护水平的加强、政府干预的放松对于区域外资投资水平提升具有促进作用，其中政府干预的放松效果最明显，对于外资投资相对水平的影响结果也是如此;而对技术市场交易额影响中，制度环境三个子项的改善对于其绝对值均有促进作用，但是产权保护水平的提升对于技术市场交易额相对值的提升却有抑制作用。