论文部分内容阅读
目的通过16S rDNA高通量测序技术比较神经发育正常及神经发育不良的新生儿肠道菌群的特点及差异,进一步探讨肠道菌群与神经发育的潜在联系,发现特定菌群对神经发育的作用。方法共纳入符合标准的94例新生儿,收集94例新生儿入院第1次的粪便样本。将94份粪便样本根据胎龄及神经发育情况分成四组(第1、2、3、4组分别对应早产神经发育正常组、早产神经发育不良组、足月神经发育正常组、足月神经发育不良组),提取粪便样本总DNA,对目前区域DNA进行PCR扩增,采用Miseq平台进行双端测序,分析各组间肠道菌群的组成和多样性。结果1、共有新生儿粪便样本96份送检,94份样本DNA测序分析成功,2份样本扩增失败。94份样本测序共得到722个OTU,共发现23个门,45个纲,58个目,111个科,203个属,200个种。2、早产神经发育正常组Chao指数、ACE指数、Shannon指数分别为47.2(31.6,120.1),51.5(37.6,151.6),0.89(0.41,1.51),早产神经发育不良组Chao指数、ACE指数、Shannon指数分别为45.5(31.8,76.7),56.2(34.3,89.8),1.01(0.47,1.31),两组间指数无统计学差异(P>0.05)。足月神经发育正常组Chao指数、A CE指数、Shannon指数分别为82.2(29.5,115.5),105.2(31.2,161.8),0.92(0.41,1.37),足月神经发育不良组Chao指数、ACE指数、Shannon指数分别为52.0(36.6,148.7),70.5(36.9,162.8),0.84(0.23,1.04),两组间指数无统计学差异(P>0.05)。3、Lefse分析结果显示早产神经发育正常组丙酸杆菌属、双歧杆菌属、韦荣球菌属、Negativicutes纲、Selenomonadles目菌群丰度显著升高,早产神经发育不良组链球菌属、慢生根瘤菌属丰度显著升高(P<0.05)。Lefse分析未发现足月神经发育正常组与足月神经发育不良组的差异菌群。4、早产神经发育正常组和早产神经发育不良组均以厚壁菌门和变形菌门占优势,对不同菌门进行Metastas统计分析,两组在门水平上菌群组成差异无统计学意义(P>0.05)。足月神经发育正常组和足月神经发育不良组均以厚壁菌门和变形菌门占优势,对不同菌门进行Metastas统计分析,两组在门水平上菌群组成差异无统计学意义(P>0.05)。5、早产神经发育正常组和早产神经发育不良组均以肠球菌属、埃希氏菌-志贺菌属为主,对不同菌属进行Metastas统计分析,两组链球菌属丰度有显著差异(P<0.05)。足月神经发育正常组和足月神经发育不良组均以肠球菌属、埃希氏菌-志贺菌属为主,对不同菌属进行Metastas统计分析,两组在属水平上菌群组成差异无统计学意义(P>0.05)。结论1、新生儿早期肠道菌群在门水平上是以厚壁菌门、变形菌门为优势菌群,而在属水平上是以肠球菌属、埃希菌属为优势菌群。2、肠道菌群与新生儿神经发育相关,链球菌属丰度增加,双歧杆菌属、韦荣球菌属、Negativicutes丰度降低可能是早产儿神经发育不良的危险因素,神经发育正常与神经发育不良的新生儿早期肠道菌群多样性无明显差异。