随着现代社会的进一步发展，非营利组织对人类社会的影响持续增加，在消除贫困等公益事业方面发挥着巨大作用。国际上专注于公益事业的非营利组织已经形成了高度的专业化管理、科学的规范运作、严谨的组织结构和高效的管理机制。相对而言，我国的非营利组织大多具有浓厚的政府背景，但随着社会的进一步需求，非营利组织需要逐渐减少自身的政府色彩，并最终建立科学、规范的员工绩效考核体系，确保组织健康、持续发展。　　基于员工绩效考核的视角，论文系统梳理了中国非营利组织目前面临的问题及原因。在此基础上，以具有浓厚政府背景的CD医学会为研究对象，通过访谈和问卷方式对CD医学会的组织现状进行深入调查，寻找CD医学会员工绩效考核方面存在的问题并分析其具体原因，确定其员工绩效构建的基本原则。基于问卷调查法确定CD医学会管理层员工和普通员工绩效考核指标体系，运用AHP法计算出各项绩效指标的权重并确定指标的评估标准。随后筛选出不同的评估主体和具体的评估方法，系统构建了CD医学会的员工绩效考核体系。构建好绩效考核这一核心工具后，再结合PDCA的绩效管理循环、不同的激励机制，进行CD医学会员工绩效管理的优化设计。本次论文的研究成果可对具有浓厚政府背景的中国非营利组织的员工绩效考核体系提供一定参考。