目的:食管癌在细胞内高甲基化基因的种类在不同地理区域、人群和种族之间有显著的差异,体现出不同人群对此疾病的遗传易感性。本研究旨在探讨食管癌甲基化易感基因在哈萨克族食管鳞癌中的表达水平及其临床意义。方法:首先,用文献检索方法筛选16个食管癌特异性高甲基化候选基因,用Methyl Primer软件预测候选基因CpG岛。其次,候选基因与人食管鳞癌全基因组寡核苷酸芯片差异表达基因交叉分析,确定哈萨克族食管鳞癌甲基化易感基因,最后,采用qRT-PCR方法和免疫组织化学法检测易感基因在哈萨克族食管癌和癌旁组织中的表达情况并分析与临床特征和患者生存率的关系。结果:16个候选基因通过甲基化CpG岛预测、食管鳞癌表达芯片差异表达基因交叉分析以及TCGA数据库查询表达水平及预后的关系等生物信息学分析,最终筛选出PTEN、FHIT、CLDN3、MLH1、MSH2等5个基因。qRT-PCR结果显示食管鳞癌组织hMSH2A和FHIT两个基因的mRNA的表达水平显著低于癌旁组织。IHC结果显示hMSH2A(P=0.010)和FHIT(P=0.002)基因在食管癌癌组织与癌旁组织表达中有明显的统计学差异,均在癌旁组织中高表达,癌组织中低表达。统计分析后发现hMSH2A和FHIT两种基因表达缺失与食管癌患者的年龄、性别及肿瘤部位无关,hMSH2A基因的分化程度(P=0.020),TNM分期中的淋巴结转移(P=0.028)情况及术后病理分期(P=0.014)有关,FHIT基因表达与肿瘤TNM分期浸润深度(P=0.031)有关。Kaplan-Meier生存分析发现,癌组织中hMSH2A基因表达阳性的患者存活率及存活时间均优于基因表达阴性的患者。两种基因在癌组织与癌旁组织中共同表达提示hMSH2A表达与FHIT表达呈正相关(r=0.430,P<0.01)。结论:甲基化易感基因hMSH2A和FHIT蛋白可能在哈萨克族食管癌发生发展中起重要作用,两种基因的联合表达的检测可作为预测恶性表型以及预后的重要指标。