农村金融一直是我国金融体系中比较薄弱的一环,农村金融的低效削弱了财政对农业的支持效果。导致农村金融市场在我国一直处于不平衡和效率低下的状态。村镇银行在某种程度上补充和完善农村金融市场,使农村经济发展得到金融支持。黑龙江省的第一家村镇银行在2008年成立,经过了将近6年的发展,黑龙江省村镇银行的发展势头良好,但由于成立时间较短,还面临着诸多问题。有鉴于此,村镇银行是否可以利用自身的优势提高其运行效率以及村镇银行能否给农户带来实惠,成了公众关心的焦点。因此,本论文以实证分析了黑龙江省村镇银行的运行效率。首先,综述了国内外研究现状,基于农村金融发展理论的农业补贴论、农村金融市场论、不完全竞争市场论以及经济学中的效率理论界定了村镇银行的内涵以及其存在的必要性,先后对比了村镇银行与一般商业银行、农村信用社以及信用合作组织的关系。其次,对影响黑龙江省村镇银行运行效率的因素进行分析,得到的研究结论是村镇银行的数量在逐年快速增长,但是相对于一般传统农村金融机构来说,村镇银行不只存在网点覆盖面比较小；股权结构不合理；盈利水平低以及经营风险大等问题。村镇银行的发展还面临着来自外部环境的挑战,比如,宏观经济政策的局限性、社会认可度低等问题,这些因素都不同程度的影响了黑龙江省村镇银行的运行效率。再次,运用DEA方法以及超效率DEA方法对黑龙江省村镇银行的运行效率进行评价研究。得到如下研究结论：综合黑龙江省村镇银行的实证结果,有将近43%的村镇银行基本达到运行效率有效,但有将近57%的村镇银行运行效率达不到有效。对于已经DEA有效的村镇银行运用超效率值进一步排序,这就解决了传统DEA模型无法解决DEA有效决策单元之间的比较分析的缺点。对于非DEA有效的村镇银行进一步进行输入输出量调整使其达到DEA有效：一是固定主营业务成本以及主营业务收入,减少存款规模、职工人数、净利润、资本金；二是固定主营业务成本、存款规模、净利润,减少职工人数、资本金同时增加主营业务收入。最后,从宏观、中观以及微观三个层面提出了加强村镇银行的稳步发展,提高村镇银行的运行效率的对策建议。宏观层面上要在宏观经济政策上加大对村镇银行的扶持力度、提高社会认可度以及改善农村社会信用环境；中观层面上要加大监管机构的监管力度以及完善市场基础设施的建设;微观层面村镇银行自身要致力于改善股权结构、提高盈利能力以及提高村镇银行的人员素质等。