云南四种少数民族G6PD基因罕见突变致病性研究

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dawancha2010
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:对G6PD缺乏症高发地区云南省德宏州傣族、景颇族、德昂族、阿昌族的G6PD基因突变检出率及突变类型进行调查,为了解该地G6PD基因突变分布规律提供参考。筛选致病性未明的可疑致病突变位点,以致病性明确的c.1388G>A、c.406C>T和c.487G>A突变作为阳性对照,并通过携带者来源的淋巴细胞和基因编辑293T细胞模型验证可疑突变位点的功能影响,为扩充G6PD基因突变谱提供数据支撑。方法:(1)对收集到的4个民族242例样本行全外显子组测序分析,根据测序注释结果筛选出G6PD基因上的突变位点,统计云南省德宏地区少数民族人群中G6PD基因突变类型分布情况。(2)根据突变统计结果,统计并筛选该地区部分致病性未明的罕见突变位点,结合生物信息学分析其突变频率、致病性及突变对G6PD蛋白结构稳定性的影响。(3)结合预测结果筛选出可疑致病突变位点,选取c.1388G>A突变男性携带者及c.406C>T突变女性杂合携带者作为阳性对照,并利用WST-8法检测突变携带者来源的淋巴细胞的G6PD酶活性,RT-qPCR及Western blot检测G6PD基因mRNA及蛋白的相对表达量。(4)利用ABE及PE单碱基编辑系统构建G6PD基因突变293T细胞株,c.406C>T和c.487G>A突变作为阳性对照,检测突变细胞株酶活性的变化,利用CCK8法检测突变对293T细胞增殖的影响,利用RT-qPCR、Western blot检测突变对G6PD基因表达的影响,结晶紫染色检测梯度浓度伯氨喹啉处理的突变细胞株对氧化性药物的耐受能力。结果:(1)对德宏地区四个民族G6PD基因突变的筛查结果显示G6PD基因变异检出率为63.64%,携带致病突变位点的检出率为12.40%,在该地区共发现39种不同的基因突变类型,其中单点突变18种,复合突变21种。c.487G>A突变是德宏地区常见的突变类型,*357A>G、VIS11-nt93T>C、c.1311C>T三个位点复合检出率高达 45%。(2)经分析,c.519C>T(p.Phe173=)、c.1398C>T(p.Thr466=)和c.475A>G(p.Met159Val)三个位点未见报道,其中 c.519C>T(p.Phe173=)和c.1398C>T(p.Thr466=)为同义突变,Clinvar数据库中显示其为良性(benign)位点,故排除致病性的可能。而c.475A>G(p.Met159Val)位点属于错义突变,在gnomADexomeALL数据库中的频率为:0.00001121,其他数据库中未见记录。Provean、Poluphen2、LRT、MutationTaster、FATHMM、GERP++RS 等软件预测结果显示该突变位点高度保守且有害。Imutant2.0、AUTO-MUTE及UCSF Chimera软件预测结果显示突变可导致蛋白结构稳定性降低,Met突变为Val可导致氨基酸残基的侧链发生改变。故推测c.475A>G突变可能具有致病性,但其功能有待进一步实验验证。(3)淋巴细胞功能检测实验结果显示与野生型细胞相比,阳性对照c.1388G>A纯合突变可导致G6PD酶活性降低,阳性对照c.406C>T杂合突变细胞株及c.475A>G杂合突变细胞株酶活性未改变,三个突变位点均不影响G6PD的表达水平。(4)单克隆细胞Sanger测序显示利用ABE及PE编辑器成功构建c.406C>T、c.487G>A、c.475A>G 293T纯合突变细胞株,酶活性检测结果显示阳性对照c.406C>T、c.487G>A突变导致G6PD酶活性下降,c.475A>G突变未导致酶活性下降。CCK8结果显示突变未对细胞增殖产生影响,RT-qPCR及Western blot检测结果显示c.487G>A突变细胞株表达水平降低,c.406C>T及c.475A>G突变不影响G6PD的表达水平。伯氨喹啉耐受性评估结果提示c.475A>G突变不影响293T细胞的抗氧化能力,c.406C>T、c.487G>A突变对伯氨喹啉耐受能力明显下降。结论:(1)云南省德宏地区傣族、景颇族、德昂族、阿昌族人群的G6PD基因突变检出率为63.64%,致病突变位点检出率为12.4%,c.487G>A突变是该地区的常见突变类型。(2)结合淋巴细胞及293T细胞模型功能学初探研究显示c.475A>G突变属于良性多态位点,不具有致病性。
其他文献
自从近几次席卷全球的国际金融危机爆发后,针对系统性风险的甄别与测量便成为了各国政府和学者们共同关注的焦点,需要明确的是这种风险不应该只是存在于金融系统内部,其更是整体性的、全局性的风险。随着我国经济金融市场的不断完善,金融业与实体经济之间的关系也日益密切,因此当金融体系中的风险积聚到一定程度后,容易溢出到实体经济当中。金融业与实体经济之间复杂的联动关系不仅为风险溢出提供了渠道,也同时会扩大风险对社
股利政策是继投资、筹资政策之后的三大财务政策之一,关于股利政策的研究备受学者们的关注,并提出了多种理论意图对现实的股利政策做出解释。从最初的股利无关论,到后来的“在手之鸟”理论、代理理论和信号传递理论等,无不体现出了学者们对于股利政策的争议和分歧。而近几年我国上市公司不断公布的“高派现”方案再次激起了学者们对“高派现”的争辩。本文结合时事热点,以汤臣倍健高派现行为进行案例分析,试图分析企业在不同财
变压器作为电力系统的重要组成部分,其内部在运行期间可能会存在机械劣化等问题。因此,变压器应及时进行诊断、保持正常运行。当变压器存在早期的形变、劣化时,变压器内部振动信号会发生改变并且可以通过变压器油等方式传播到箱体表面。本课题主要针对变压器振动信号进行分析。首先,本课题对变压器振动机理进行分析。其次,本文将自适应噪声完全集合经验模态分解(Complete Ensemble Empirical Mo
化石能源的快速消耗使人类的生存家园面临了极大的考验,可再生能源的清洁利用是缓解传统化石能源的快速消耗和减少日趋严重的环境污染的有效手段之一。基于碳中和理论,利用生物质能来控制CO2减排是人类生存发展的必然趋势,而生物质应用于热转化技术来生产生物燃料的应用已经成为目前的热点。本文以富脂质类生物质小球藻粉和发酵丝孢酵母为原料,采用水热液化技术(HTL)来实现资源化的利用,尝试用水热生物油的生产来减缓石
随着信息产业的发展和制造业逐渐由单一生产型向“生产+服务”型的转变,加快制造业与服务业的融合共生、协同发展,是实现制造业高质量发展的必然选择。生产性服务业是一种与制造业直接相关配套的服务业,贯穿于制造业整个生产过程中,把专业化的服务要素投入制造业,是加速二、三产业融合的关键环节,因此,一国要想提高制造业竞争力水平,生产性服务业的作用不容小觑。本文基于生产性服务贸易自由化,研究其对制造业国际竞争力的
党的十九大报告明确提出,不仅要把创新作为引领发展的第一动力,还要把它作为建设现代化经济体系的战略支撑。技术创新能力作为企业的核心要素,不仅影响企业市场竞争态势,也决定企业的生存与发展。十九届五中全会提出要坚持创新在现代化建设全局中的核心地位,再次表明了我国以创新作为发展支撑的坚定决心。企业是创新主体,也是创新主战场,要顺利实现创新驱动的目标任务,就必须把握好企业技术创新这条主线,克服存在的短板与不
数学建模是联结理论与实际的桥梁,是新课程改革的一个重要目标。数学建模活动是将数理知识与实际生活相结合的过程,是把素质教育的具体要求落实在课堂教学的一种方式。高中学段的学生需具备一定的数学建模能力,因此数学建模的教学在现代教育中有着重要的地位与作用。笔者希望通过任务驱动式合作学习的教学模式帮助学生提升数学建模能力,帮助学生掌握“问题转化”能力,学会抓住数学问题的要点,提升解题效率。笔者选取了上海市某
在建设美丽中国方针的指导下,博览园越来越多样化,博览园的重要性和影响力也越来越明显。同时,为推进发展国家“双碳”战略,建筑业作为碳中和工作的重要领域之一,需要在各个环节积极改革与完善。为达到资源有效整合与利用,建设工程项目策划作为建设实施的前提,其扮演的角色不容忽视,而国内外研究多是围绕建筑设计规划层面的研究,鲜有对建设实施全流程策划的研究,长此以往必将形成设计与施工的脱节,造成施工目标不明确、组
采购在公司整体供应链上是个十分关键的环节,很多企业都非常重视采购环节,而且企业采购要是从供应链的角度加以整体设计和优化,则会减少公司的采购成本,提升公司的运营效益,提升公司的总体实力与管理水平。而食品行业历来是一个重要的行业,它不仅影响人们的生活质量,还反映国家的经济水平。跟其他行业相比,它是比较特殊的,尤其表现在供应链上,在食品行业的供应链中,有一个企业是占据主导地位的,而且只有这个企业才能保证
复合配筋预应力混凝土实心方桩,是同时配置预应力钢棒及非预应力螺纹钢筋的混凝土预制方桩。可以工厂化大批量生产,具有生产效率高、环境友好和成本低等优点,已广泛应用于基础设施的桩基工程。由于生产和运输等条件的限制,单节桩长一般在15m以内,需要在现场进行接桩处理。接桩后,桩的承载力不仅与桩身有关,也与连接接头紧密相关。当前,我国预制桩通常采用的接桩方式主要有焊接和机械连接两种。焊接法耗时长,对工期影响较