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目的:不明原因智力障碍/发育迟缓(Intellectual Disability/Developmental Delay,ID/DD)是儿童发育过程中的一种常见致残性疾病,病因复杂、表型多样,给患者及家庭带来沉重的心理与经济负担。本研究应用微阵列比较基因组杂交技术(Array-based Comparative Genomic Hybridization,Array-CGH)对不明原因ID/DD患者进行染色体基因组拷贝数变异(Copy number variations,CNVs)检测,分析CNVs与ID/DD相关性,并对致病性CNVs(pathological CNVs,pCNVs)进行来源分析,为遗传咨询及产前诊断提供理论基础。方法:根据入选标准,收集北京大学第一医院儿科门诊自2014年11月至2015年10月就诊的不明原因ID/DD患者,采集患者及其父母外周血,制备基因组DNA,应用Array-CGH芯片技术对患者进行染色体基因组拷贝数变异检测,将所得CNVs结果与正常人群CNVs数据库(Database of Genomic Variants,DGV)、异常表型数据库(Decipher数据库)、在线孟德尔遗传性疾病数据库(OMIM数据库)和Pubmed文献数据库进行对比,分析CNVs的致病性,对可获得父母样本的患者进行pCNVs验证及父母来源分析。结果:本研究共收集并检测了31例不明原因ID/DD患者,在6例(19.3%)患者中共发现7个pCNVs,涉及4个已知综合征,分别为1p36缺失综合征(OMIM 607872)、22q11.2缺失综合征(OMIM 611867)、Pitt-Hopkins综合征(OMIM 610954)以及NRXN1微缺失综合征(OMIM 600560)。另外发现了3个数据库中暂未定义综合征或疾病区域的pCNVs,分别为3p26.3p26.2、11q22.3q25和15q21.3-q22.2区域的杂合缺失。结论:基因组pCNVs是不明原因ID/DD患者的主要遗传学病因之一,Array-CGH技术对pCNVs检出率约为15%~20%。本研究应用Array-CGH芯片检测技术明确了19.3%(6/31)的不明原因ID/DD患者遗传学病因,为这些家庭进行遗传咨询和产前诊断提供理论依据。同时,发现了3处尚未定义综合征或疾病区域的pCNVs,为新综合征的发现提供了线索。Array-CGH芯片检测技术是高通量、高分辨率和高敏感性的基因扫描技术,建议将其作为不明原因ID/DD的首选遗传学检查方法。