拟异小杆属(Heterorhabditidoides)线虫隶属于小杆科(Rhabditidae),与沙雷氏菌属(Serratia)细菌共生。前期研究发现该类线虫对鳞翅目(Lepidoptera)、双翅目(Diptera)和鞘翅目(Coleoptera)害虫具有较强的毒杀作用。并发现该类线虫中存在较强与炎症和免疫反应相关的活性因子。但目前该类线虫的基因组信息还很匮乏,其与共生菌互作机制及相关杀虫机理还不清楚。为进一步了解该类线虫-共生菌共生体的相关功能机制,本研究提取不同发育阶段的Heteterhabditiroides-serratia共生体的总RNA,通过高通量De-novo测序得到其较完全的转录组数据,基于转录组水平利用系统生物信息学技术解析该类昆虫病原线虫-共生菌共生体的全基因组范围的基因表达情况及可能的调控机制;为进一步研究该类昆虫病原线虫的杀虫机理、发掘其特有基因的应用价值和后续分析研究提供参考数据库。主要结果如下:(1)组装后共得到60,869,584条Raw Reads,经过滤处理后得到54,317,530条Clean Reads,mean reads = 90 nt。最终获得 34,187 条 Unigene 序列,平均长度为 770 nt,N50值为 1300 nt。(2)将组装得到 34,187 条 Unigene 与 Nr、Nt、Swiss-Prot、GO、COG、KEGG数据库进行同源比对分析,发现有21,255条能够得到注释,占全部Unigenes的62.2%。GO分析中能匹配到分子功能、细胞组分、生物过程的Unigenes共有12,416条,Unigene富集较多的子类别有“Single organism process”、“Cell”、“Binding”。COG 功能分析结果显示有8,332条Unigene能匹配到25个COG类别中。KEGG通路分析结果显示有14,066条Unigene能被归类到六大类生化途径中,参与257个通路。SSR分析结果显示一共得到942个SSR标记。在这些SSR标记中,分布最多的SSR类型为三碱基型,其次是双碱基型和单碱基型,这三种SSR类型共占总标记的98.0%,而其余的碱基型仅占2.0%。SNP分析结果显示,在Heterorhabditidoides-serratia中共检测出153,084个SNP多态位点,其中转换类型占68.9%,颠换类型占31.1%。最后分析预测了与昆虫病原线虫分泌纤溶活性蛋白、生长发育、衰老、免疫及其共生菌致病性相关的功能基因及信号通路,为进一步研究昆虫病原线虫的生理机制提供了基础。