巡飞弹作为能在目标区进行巡逻飞行，可承担监视、侦察、战斗毁伤评估、空中无线中继及攻击目标等单一或多项任务的弹药，它的众多优点使其将成为未来弹药领域发展的一个重要趋势。本文采用现代科学发展的结晶GPS制导系统，并结合弹箭制导原理，对巡飞弹的导航控制系统进行了研究。首先阐述了GPS的定位原理和常规的GPS的动态定位算法，通过设计GPS数据接收系统来获得导航数据编程来获得导航数据，并用卡尔曼滤波的理论将GPS所测的数据进行滤波处理，提高了定位精度。其次根据控制系统原理，确定巡飞弹控制方案。随后分析了巡飞弹的动态特性，重点建立了巡飞弹的控制系统模型，并利用MATLAB工具对巡飞弹控制系统进行设计和仿真，证明所设计的控制系统是合乎技术要求和设计性能要求的。最后对控制系统的软硬件进行总体设计，完成整套系统的设计。