鉴别犬瘟热病毒强毒株和弱毒株的复合RT-nPCR方法的建立及初步应用

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wodeziyuan
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犬瘟热(Canine distemper,CD)是由犬瘟热病毒(Canine distemper virus,CDV)感染犬或其它食肉目动物引起的一种高度接触传染性、致死性疾病,CDV属于副粘病毒科麻疹病毒属,该属成员还包括麻疹病毒(MV)和牛瘟病毒(RPV)。CDV是负链单股不分节段的RNA病毒,基因组全长15690nt,主要由N基因,P基因,M基因,F基因,H基因,L基因组成,只有一个血清型。本研究旨在建立一种能区分CDV强毒株、弱毒株的复合RT-nPCR的检测方法。根据GenBank上登录的所有CDV基因组全序列,选择CDV强、弱毒株间有差异区域,选择其高度保守区设计了一对通用引物P1和P4,并在该对引物跨越区域的内部设计了CDV强毒株特异性引物P2及弱毒株的特异性引物P3,用引物P1/P4进行RT-PCR,然后用引物P2/P3/P4进行复合套式PCR,建立了一种能区分CDV强、弱毒株的复合RT-nPCR的鉴别诊断方法。应用该方法从CDV强、弱毒株的基因组中分别扩增出了大小为247bp和177bp的特异性片段,从两种病毒基因组混合物中扩增出了大小为247bp和177bp的两条特异性片段,与犬细小病毒(CPV)、犬腺病毒(CAV)、犬冠状病毒(CCV)、狂犬病病毒(RV)、新城疫病毒(NDV)的细胞培养物,以及正常细胞对照组进行复合RT-nPCR扩增时均为阴性。该方法敏感性为可以检测到相当于1×10-1TCID50的病毒RNA。检测耗时短,最快可在6h内完成。对从黑龙江省及吉林省采集的30份疑似CD病料(分别来自于犬、狐、貉的脾脏、肝脏、肺脏、膀胱)进行了检测,结果表明,有20份为CDV,其中15份为CDV强毒株,5份为CDV弱毒株。选择2株复合RT-nPCR检测为强毒的样品(HLJ-1、HLJ-2)与GenBank中其余25株具有代表性的CDV毒株进行H基因序列分析,结果显示,复合RT-nPCR的检测结果是准确的;并且目前CDV各病毒株之间由于地域性及年代的不同,主要可区分为强毒株与弱毒株两个基因型,其中强毒株又可分为亚洲1型(Asia-1)、亚洲2型(Asia-2)、欧洲型(Europe)、美国型(USA)、北极型(Arctic)等五种基因型。我国有3株流行野毒(giant panda、TN、Guizhou)属于Asia-1型,1株流行野毒(Liu)属于Arctic型,HLJ-1、HLJ-2均属于Asia-2型。本研究建立的复合RT-nPCR可以检测CDV感染,并能作为强毒株、弱毒株的鉴别诊断方法,可用于临床快速检测,流行病学监测。
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