基于XML构建生物信息二级数据库

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提出并实现了一种生物信息二级数据库的构建方法。该方法采用NCBI维护的一级数据库作为核酸和蛋白质序列数据来源,以Oraele9i作为后台软件,所有的应用程序基于Java开发。通过代理程序自动获取Web数据,并以XML作为中间格式保存,然后通过解析提交到二级数据库中,同时转换成便于Web发布的HTML格式。该方法既方便对语义的机器解析,又有效地保证入库信息的完整性,显著提高了二级数据库的开发效率。
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