基于K-mer-SVM的piRNA预测

来源 :福建农林大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:syw2565
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
采用支持向量机(SVM)结合K-mer分布特征预测piRNA.利用多种生物的非编码RNA序列数据库,从中挑选出piRNA序列作为正样本,并以由该数据库构建的非piRNA序列作为负样本,将正样本和负样本构成的数据随机取出50%作为训练集,将剩余的数据作为测试集;提取正样本和负样本序列的K-mer分布特征构建特征矩阵;用SVM对其进行分类,实现piRNA预测.结果表明K-mer-SVM在准确率、正例覆盖率、MCC和F测度等分类指标上均明显优于K-mer-LDA,说明K-merSVM是更好的piRNA预测算法.
其他文献
初中物理知识较为复杂,教学难度也大。很多教师在教学过程中只注重理论知识的教学,却忽视了“以人为本”的教学理念。教学只有做到民主化,师生关系平等,学生充分发挥自主能动性,才
2007年10月19日,服务科学、世界领先的赛默飞世尔科技与中国兴奋剂检测中心在北京签署了2008年奥运会兴奋剂检测项目合作计划书。协议确定了赛默飞世尔参与和支持2008年奥运会
摘 要:自主、合作、体验是新课改下的主要学习方式。从把握体验学习特征——重学习过程、重已有的生活经验以及重知识和技能的运用等方面,论述小学体育教学中开展体验学习的策略。  关键词:小学体育;体育教学;体验学习;有效课堂  体育教学中重“教”轻“学”,忽视了学生的心理健康发展、忽视了运动规律的认识和探究,体育运动的方式与学生的身心健康、认知特点不吻合等,导致体育教学效果的不尽如人意,突出表现在,学生
道德、品质是人生活、生存和发展的需要,是人类文明进步的保证。初中政治教育教学的重点之一是培养学生良好的道德品质和情操素养,促成学生心身健康的发展,增强学科和学习素
摘 要:随着我国新课程标准的实施,小学数学课程改革已经不断深入发展,在学习中通过开展自主、合作学习,帮助学生养成自主探究能力,加强合作精神,有助于培养学生良好的学习品质。通过开展小学高年级数学自主探究式教学活动,积极带动学生的参与热情,使学生能够提高数学知识的应用能力,也为日后的数学学习打下夯实的基础。  关键词:数学教学;自助探究;互动学习;学习模式  通过开展数学活动,增强学生的模仿能力与记忆
学困生的转化教育是学校经常遇到的问题,教育工作者需要认真对待这个问题。学困生的转化教育是教育工作的一个薄弱环节。学困生产生的原因有社会、家庭、经济等各方面因素,主
文章探讨了大型火力发电厂钢煤斗吊装托运工艺特点、适用范围、工艺原理、施工方法及效益分析,推广使用该工艺。
兴趣以需要为基础。需要有精神需要和物质需要,兴趣基于精神需要(如对科学、文化知识等的需要)。人们若对某件事物或某项活动有需要,他就会热心于接触、观察这件事物,积极从事
日本生物技术风险企业G&G科学公司开发了一套能用于保护鹿儿岛产黑猪等品牌以及防止伪造标识的DNA鉴定体系.为将这项技术应用于琦玉县的中坚食品超市——倍仓公司的质量管理中,
医药是关系到国计民生和保持中华民族核心竞争力的头等大事.然而中国目前的制药工业水平与中国的大国地位极不相称。寻找适合于中国医药研发现状的新药研发策略成为当前一个时