目的：了解血液系统恶性肿瘤患者治疗期间发生血流感染的病原菌流行病学特征并比较HSCT对其的影响，为血流感染诊疗提供依据。方法：收集2017-2021年解放军总医院第一医学中心血液科发生血流感染的住院病例，根据是否行HSCT分为HSCT和N-HSCT两组，分析比较两组血流感染病原菌的流行病学特征及其影响。结果：共收集292例病例，362株病原菌，HSCT组（84例）106株，N-HSCT组（208例）256株；急性髓系白血病（44.52%）发生血流感染较多见，其次是非霍奇金淋巴瘤（25.34%）；发生一次血流感染的比例HSCT组高于N-HSCT组，发生两次血流感染的比例N-HSCT组较高；病原菌以革兰阴性杆菌为主（56.07%），大肠埃希菌占绝对优势（30.11%），其次是肺炎克雷伯菌（10.77%）；革兰阳性球菌以葡凝固酶阴性葡萄球菌（29.56%）为主；HSCT组的真菌检出率（9.43%）明显高于N-HSCT组（3.52%）；常见病原菌的耐药率均处于较高水平，多重耐药菌株存在一定比例（铜绿假单胞菌除外）；HSCT组凝固酶阴性葡萄球菌对青霉素、庆大霉素、莫西沙星、克林霉素、利福平的耐药率高于N-HSCT组；HSCT组的大肠埃希菌对哌拉西林/他唑巴坦、头孢类抗生素和厄他培南的耐药率明显高于N-HSCT组。结论：血液系统恶性肿瘤患者血流感染的病原种类复杂多样，多次感染和多个病原菌的检出给临床诊疗带来了困难。HSCT患者较高的真菌血流感染风险和多重耐药菌株检出。因此，对HSCT患者的血流感染及多重耐药菌株应加强监测。