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基于PC/Linux的核酸序列分析系统的构建及其应用
基于PC/Linux的核酸序列分析系统的构建及其应用
来源 :生物化学与生物物理进展 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wjh75
【摘 要】
:
基于PC机和Linux操作系统 ,利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件 ,构建了核酸序列大规模自动分析系统 .该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序
【作 者】
:
张成岗
欧阳曙光
张绍文
瞿祥虎
鱼咏涛
周钢桥
【机 构】
:
军事医学科学院放射医学研究所基因组学与蛋白质组学研究室!北京100850; 军事医学科学院放射医学研究所基因组学与蛋白质组学研究室!北;
【出 处】
:
生物化学与生物物理进展
【发表日期】
:
2004年期
【关键词】
:
PC机
Linux操作系统
Phred/Phrap/Consed软件
Blast软件
生物信息学
大规模测序
【基金项目】
:
军事医学科学院科技创新研究启动基金! (990 5 10 5 ) ;国家“86 3”项目! (86 3 10 2 10 0 4 0 4);国家杰出青年科学基金!(396 2
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基于PC机和Linux操作系统 ,利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件 ,构建了核酸序列大规模自动分析系统 .该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性分析 ,可加速对大规模测序数据的分析和利用 .
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