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动物科学学院的办学历史可追溯至1909年创办的广东农事试验场附设农林讲习所。1952年由中山大学、岭南大学、广西大学农学院畜牧兽医系组建成华南农学院畜牧兽医系，设畜牧专业。1987年畜牧兽医系分为畜牧系和兽医系．1992年畜牧系改名为动物科学系．2001年动物科学系改为现名动物科学学院。2003年蚕丝科学系并入动物科学学院。