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中医药是中国传统文化的宝库,为中华民族的繁衍生息做出了巨大贡献。其在整体观念、阴阳平衡、藏象理论、扶正祛邪等理论暗合肠道菌群动态平衡理论,中医药在调控肠道菌群结构、菌群位移、菌群功能、中药剂型剂量和中药配伍对肠道菌群影响等领域研究广泛,效果明显,然而其明确的作用部位和靶点、免疫相关性、基因改变等还有待于进一步深化。