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2001年兵团着手设立了兵团博士资金，用于资助优秀博士人才在兵团开展应用基础研究和高新技术研究。5年来共收到博士资金申请项目125项。其中有61项是中科院、清华大学、北京大学等27所院校的博士与兵团有关单位联合申报的项目，占总项目数的48．03％；安排博士资金项目37项，实施资金500万元。其中“哈密瓜细菌果斑病种子带菌分子检测技术及品种资源抗性评价”项目整体研究达到国内领先水平。