【摘 要】
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MADS是一类植物转录因子基因家族,主要调控开花植物花和果实的不同发育过程.为了研究映山红杜鹃MADS基因家族的特征,加快映山红基因工程育种进程,本研究基于已发表映山红染色体水平基因组数据库,对映山红MADS基因家族的所有基因进行生物信息学分析.结果 发现,映山红基因组中共有67个MADS家族基因,其理化性质差异较大,且在13条染色体上的分布不均匀;对映山红和模式植物拟南芥MADS蛋白的系统进化分析显示,映山红MADS基因家族中也包含Ⅰ型和MIKC型两大类型,其中MIKC型中包含有花发育相关的B类和E类基
【机 构】
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信阳农林学院园艺学院,信阳,464000;贵州大学农学院,贵阳,550025;贵州省农业科学院园艺研究所,贵阳,550006
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MADS是一类植物转录因子基因家族,主要调控开花植物花和果实的不同发育过程.为了研究映山红杜鹃MADS基因家族的特征,加快映山红基因工程育种进程,本研究基于已发表映山红染色体水平基因组数据库,对映山红MADS基因家族的所有基因进行生物信息学分析.结果 发现,映山红基因组中共有67个MADS家族基因,其理化性质差异较大,且在13条染色体上的分布不均匀;对映山红和模式植物拟南芥MADS蛋白的系统进化分析显示,映山红MADS基因家族中也包含Ⅰ型和MIKC型两大类型,其中MIKC型中包含有花发育相关的B类和E类基因,即可能参与对映山红花瓣及胚珠的发育调控;映山红花发育5个不同阶段的MADS基因表明分析结果显示,67个MADS中有39个基因被检测到,且表达趋势差异较大,表明映山红MADS基因的表达具有时空特异性,部分MADS基因在此阶段不表达.本研究结果可为映山红的定向遗传改良提供重要参考.
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本研究为揭示软枣猕猴桃中无色花色素双加氧酶(leucoanthocyanidin dioxygenase,LDOX)基因结构及其功能.运用生物信息学方法对软枣猕猴桃LDOX核苷酸及氨基酸序列进行深入分析,构建LDOX基因的蛋白互作网络,并进行GO及KEGG功能注释分析.结果显示:软枣猕猴桃与野茶树、以南高丛蓝莓、蓝莓、金银花及胡萝 卜亲缘关系较近,含有10个保守基序.顺式调控元件主要参与ABA信号途径、响应干旱应答,厌氧诱导、赤霉素、生长素响应因子、MeJA反应、低温响应、光刺激应答响应元件.LDOX理化
GRF (Growth-regulating factor)基因家族是一种广泛分布于种子植物的转录因子,在调节植物的生长、发育中发挥重要的作用.本研究从葡萄基因组鉴定出8个VvGRF基因,命名为VvGRF1～VvGRF8.采用生物信息学的方法,系统地对葡萄VvGRF家族的蛋白理化性质、进化关系、保守基序及在不同发育时期的差异性表达进行预测和分析.结果 表明,VvGRF基因内含子与外显子数量差异较小,在所有预测蛋白的N端含有两个典型的保守结构域QLQ与WRC;系统进化分析将GRF家族成员分为6组,其中葡萄与
温度是影响植物生长发育重要的环境因子之一,光敏色素互作因子PIF4是植物响应温和高温的核心基因,明确MdPIF4在苹果温度响应中的作用具有重要意义.本研究克隆了MdPIF4的编码区和启动子序列,分析了MdPIF4的表达情况,对MdPIF4转录激活活性进行了分析和互作蛋白筛选,并在野生型拟南芥中异源过表达了MdPIF4.结果 显示:MdPIF4基因编码区包含1656 bp的核苷酸,编码551个氨基酸,预测其蛋白质分子质量为60670.87 Da,等电点为6.63.MdPIF4在苹果叶片中的表达量最高,其次为
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