加权基因共表达网络分析溃疡性结肠炎发病机制

来源 :牡丹江医学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ghchao0605

【摘要】

：

目的探究溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)发生发展的致病高风险驱动基因,以及UC异常改变的信号通路。方法从GEO(gene expression omnibus)数据库下载基因表达谱数据GSE1

【作者】

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邱收张凯旋任丹丹于鑫

【机构】

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牡丹江医学院基础医学院免疫学教研室,牡丹江医学院医学影像学院

【出处】

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牡丹江医学院学报

【发表日期】

：

2020年2期

【关键词】

：

溃疡性结肠炎 WGCNA 分子机制致病高风险驱动基因信号通路 Ulcerative colitisWGCNAmolecular mechanismhigh-

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目的探究溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)发生发展的致病高风险驱动基因,以及UC异常改变的信号通路。方法从GEO(gene expression omnibus)数据库下载基因表达谱数据GSE16879,通过R中WGCNA软件包进行加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),筛选出UC高风险因子共表达模块基因;采用limmar软件包筛选UC以及正常结肠样本的差异表达基因(Differentially

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