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科技创新要成为经济增长引擎必须获得相应的资金支持。本文利用DEA方法测度了2000-2013年间我国27个省份科技创新活动的资金配置效率,在剔除规模报酬因素后,对造成纯技术效率时空差异的影响因素进行分析,结果表明,政府扶持、直接融资及间接融资等结构性资金投入会显著影响资金配置效率,并据此提出了相应的对策建议。