【摘 要】
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对乌拉尔甘草根进行转录组测序分析，挖掘响应盐、低磷和干旱胁迫的相关基因，探讨甘草抵御逆境胁迫的分子机制。以150 mmol/L NaCl模拟盐胁迫、10 μmol/L KH2PO4模拟低磷胁迫和15%聚乙二醇（PEG-6000）模拟干旱胁迫处理下的乌拉尔甘草根作为研究材料，应用Illumina HiSeq 2000测序平台对根进行转录组测序，对测序结果进行基因功能注释分析和差异表达基因（DEGs）
【机 构】
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陕西中医药大学药学院陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心
【基金项目】
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国家自然科学基金项目（31600320）； 陕西省社会发展科技攻关项目（2018SF-338）； 陕西中医药大学“秦药”品质评价及资源开发学科创新团队项目（2019-QN01）共同资助；
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对乌拉尔甘草根进行转录组测序分析，挖掘响应盐、低磷和干旱胁迫的相关基因，探讨甘草抵御逆境胁迫的分子机制。以150 mmol/L NaCl模拟盐胁迫、10 μmol/L KH2PO4模拟低磷胁迫和15%聚乙二醇（PEG-6000）模拟干旱胁迫处理下的乌拉尔甘草根作为研究材料，应用Illumina HiSeq 2000测序平台对根进行转录组测序，对测序结果进行基因功能注释分析和差异表达基因（DEGs）筛选。分别获得盐、低磷和干旱胁迫处理下甘草根中4 294、3 201和4 719个DEGs。GO富集结果表明，3种逆境胁迫下甘草根中的DEGs均显著富集到细胞过程、代谢过程、刺激响应、细胞、细胞器、催化活性等功能过程中；KEGG途径富集分析表明，3种胁迫处理下的DEGs显著富集的代谢途径主要涉及基因表达调控、生物合成及代谢、信号转导等。转录因子鉴定结果显示三种胁迫处理下差异表达数量最多的转录因子主要来自ERF、bHLH、MYB-related、WRKY、Dof、NAC等转录因子家族；基因表达水平分析显示，参与植物激素代谢及信号转导相关的DEGs在盐胁迫处理下多数表达水平下降，在低磷与干旱胁迫处理下多数DEGs呈上调表达。通过高通量转录组测序，初步获取了乌拉尔甘草根响应盐、低磷和干旱胁迫的基因表达特征，为深入研究甘草抗逆机制提供理论依据。
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