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基于密度泛函理论,利用B3LYP方法对烟酰胺直接甲基化的反应机理进行了研究,并采用CPCM模型计算了蛋白质环境的影响.计算结果表明,甲基作为阳离子进行转移,反应过程是一个SN2反应,反应自由能垒为90.3 k J/mol,比实验测得值略高,说明酶在此反应中所起的作用有可能是把底物组织成一个合理的构象空间.