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早期“生物矿化作用”的概念，被定义为生物形成矿物的作用，并进一步分为生物控制和生物诱导两大类型。这个宽泛的概念，被修订为生物以生命活型（1ivingform）影响矿物物质的沉淀作用；相应地，“生物矿物”是在严格的生物控制下、从局部环境中选择性地吸收元素并融合成具有生物功能构造的矿物。“有机矿化作用”，则被定义为“与那些无生命活力的有机物质相关联的矿物形成作用”。与生物矿化作用相对应，有机矿化作用的产物被定义为“有机矿物”，用来指那些通过有机聚合物、生物的和（或）非生物的有机化合物所导致的矿物沉淀作用，但是