【摘 要】
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苦荞是一种重要的杂粮作物。利用GenBank数据库中苦荞的8条染色体基因组序列进行SSR标记挖掘,并基于Primer 3.0设计SSR引物,筛选多态性高的引物进行遗传多样性评价。共检测到51 485个SSR位点,平均发生频率为114.07 Mb-1,二核苷酸重复型最多（78.20%）,其次为三核苷酸重复型（17.76%）。苦荞SSR中包含361种类型重复基元,具有碱基偏好性,优势基元为AT/TA（
【机 构】
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中央民族大学民族地区生态环境国家民委重点实验室
【基金项目】
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生态环境部生物多样性调查评估项目（2019HJ2096001006）； 国家自然科学基金项目（81274185;81373765）； 国家民委中青年英才项目（2016-03-01）； 中央民族大学一流大学一流学科建设项目；
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苦荞是一种重要的杂粮作物。利用GenBank数据库中苦荞的8条染色体基因组序列进行SSR标记挖掘,并基于Primer 3.0设计SSR引物,筛选多态性高的引物进行遗传多样性评价。共检测到51 485个SSR位点,平均发生频率为114.07 Mb-1,二核苷酸重复型最多（78.20%）,其次为三核苷酸重复型（17.76%）。苦荞SSR中包含361种类型重复基元,具有碱基偏好性,优势基元为AT/TA（69.60%）、AAT/TTA（2.49%）和AGA/TCT（2.10%）。序列长度变化范围为12～228 bp,长度12～20 bp的占比57.93%,长度大于20 bp的占比42.07%。SSR位点分布在每条染色体上的数量和种类特征较为一致,不同染色体能检出的SSR种类具有特异性。根据不同类型SSR位点设计并合成156对引物,筛选出17对多态性较高的引物用于遗传多样性分析,发现42份苦荞地方品种资源具有较高的多样性,美姑县的黑苦荞遗传多样性最高,布拖县的样品多数聚为同一分支,多样性显著低于美姑县和昭觉县的品种,西南种质库保存的野生苦荞与其他栽培品种明显分离。通过大量SSR的挖掘特别是染色体特异性SSR位点的挖掘,对苦荞种质资源的鉴定分析以及苦荞分子标记辅助育种有重要意义;遗传多样性检测也显示了SSR分子标记的可用性,以及黑苦荞的遗传多样性水平,对苦荞遗传多样性保护研究提供了新的途径。
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