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西南六省区市地理位置相近、地域特征相似、民族文化相融,在创新驱动发展具体内容方面具有较大的趋同性,同时又具有特征鲜明的差异化产业发展,具备利益共享、协同创新的现实基础。本文通过研究区域协同创新相关理论和实践案例,对照西南六省区市基本情况,形成西南六省区市协同创新的政策建议,包括搭建区域协同创新平台、促进智力资源合理流动、建立区域协同创新机制、统筹多层利益分配机制四个方面。