梨全基因组生长素反应因子(ARF)基因家族鉴定及表达分析

来源 :中国农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mdyd888
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
【目的】明确梨ARF转录因子在梨基因组中的数量、结构和组织表达差异,为揭示ARF转录因子在梨树生长素信号途径及在矮生梨生长发育中的作用奠定理论基础。【方法】根据文献报道的苹果、拟南芥等植物中的ARF转录因子基因,利用BLAST软件鉴定梨基因组中的ARF。采用SMART、PROSITE、Web Logo 3、DNAMAN 5.0、MEME、GSDS 2.0和MEGA 5.1等软件对其蛋白和基因序列进行生物信息学分析。采用q PCR方法检测梨ARF在矮生梨‘中矮1号’不同组织器官及3个不同生长势梨品种木质部和韧皮部中的表达情况。【结果】鉴定得到31个梨ARF,所有Pb ARF蛋白均含有1个Auxin_resp结构域和1个B3结构域,除Pb ARF11、12、24、25和26外,其他序列的C末端还存在一个PB1(AUX_IAA)结构域。保守元件分析表明,Pb ARF基因家族包含15个保守元件,并非每个蛋白均含有所有保守元件。分组鉴定和进化树分析结果显示,Pb ARF蛋白可以被分为4组。基因结构分析表明,Pb ARF基因家族成员由2—15个外显子组成,基因结构进化高度保守。q PCR结果显示,所有Pb ARF在‘中矮1号’根、韧皮部、木质部、叶、花和果实中均有表达,表达模式各有不同,Pb ARF29在3个梨品种韧皮部中的表达表现出植株越矮表达量越高的趋势,Pb ARF16、17、18、27等4个基因在3个梨品种木质部中的表达表现为植株越矮表达量越低的趋势。【结论】梨基因组中含有31个ARF基因家族成员;所有Pb ARF蛋白均含有Auxin_resp和B3两个高度保守的结构域;Pb ARF结构进化高度保守;所有Pb ARF在‘中矮1号’不同组织器官、基砧杜梨根系及3个梨品种的木质部和韧皮部中均有表达,其中,Pb ARF29、16、17、18、27等5个基因的表达可能与梨树植株的高矮有关。
其他文献
高考作文越来越注重文体,一篇好的记叙文可以让学生在语文学科考试中占得先机,那么如何写好一篇记叙文呢?笔者认为,一篇优秀的记叙文要做到“曲折有波澜”,既要有内容上的曲折
伴随着市场经济的不断发展和进步,企业要结合管理控制要点进行综合监督,企业管理人员要按照经营目标完善各项活动基础,从根本上提高管理工作的时效性,就能为企业全面可持续发
数学是一门思维严密、逻辑性很强的学科。怎样能通过一堂课把教育内容环境化、教材选择人本化、教学过程生活化,这就要根据智障学生接受慢、遗忘快的特点,将教育培养的内容,
在没有电灯的年代,马灯是农村生活最常见的必需品。正是这一盏盏最普通不过的马灯,成为照亮漫漫长夜、指引曲折道路的关键物品。在电没普及前,人们夜晚出行,大多靠火把照明。如今
高校网络舆情是社会网络舆情的重要组成部分,以安徽省某高校调查研究为例,以调查问卷方法分析了高校网络舆情的主要内容、大学生关注舆情的主要载体途径,根据调查内容分析出
小学低年级学生天真烂漫,教师要结合实际情况,巧妙创设情境,激发学生的识字兴趣。同时灵活运用多种识字方法,拓展识字途径,尽力为他们搭建想象和创造的舞台,让低年级学生在文
10月24日~26日,中国种子协会在南京召开了全国各种子期刊年会。全国种子总站站长,全国种子协会付理事长王克平同志就全国种子工作问题多次发言。现摘要如下: 1 1995年工作要
期刊
本文介绍了拉杆便携式光伏供电系统的材料选择,结构设计,功能优势等。拉杆便携式光伏供电系统采用轻质高强度材料做箱体,配有高效太阳能电池组件,能提供直流电压和交流电压输出供
<正>一、实践背景(一)知识背景高中政治主观性试题具有信息量大,能力层次高,综合要求强,选拔功能突出等的特点。尤其在高考考查时,更加突出能力立意,全面深入考察获取和解读
根据学生的年龄特征,低年级的识字教学应该充分利用儿童的生活经验,创设丰富多彩的教学情境。许多教师在识字教学中往往存在误区:整节课把所有精力放在文章内容的理解上,识字