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目的研究褐家鼠线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ（COⅠ）基因的遗传多态性特征,为国境口岸鼠形动物的鉴定和溯源提供技术支持。方法通过对江苏口岸本底及输入性褐家鼠COⅠ基因的扩增、测序和比对,结合GenBank的褐家鼠信息,对褐家鼠进行遗传多态性分析和系统发育树研究。结果获得48个国内外褐家鼠COⅠ基因序列,测出的605个序列位点中保守位点587个,可变异位点18个,核苷酸平均差异数为（2.510000±0.000640）;江苏口岸本底褐家鼠仅为1个单倍型,非江苏口岸褐家鼠多态性丰富。结论不同地区的褐家鼠具有一定的种内差异,该差异与地理位置分布有一定的关系。